17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0262 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  100 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1150  hypothetical protein  53.94 
 
 
259 aa  273  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3348  hypothetical protein  55.25 
 
 
260 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  48.66 
 
 
286 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1417  hypothetical protein  50.39 
 
 
259 aa  251  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0513  hypothetical protein  47.33 
 
 
278 aa  242  6e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.891131  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0067  hypothetical protein  44.23 
 
 
261 aa  221  9e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4887  hypothetical protein  37.61 
 
 
275 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4514  hypothetical protein  32.38 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0645  hypothetical protein  48.67 
 
 
164 aa  112  7.000000000000001e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.881182  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0969  hypothetical protein  36.27 
 
 
271 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  26.73 
 
 
276 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0815  ORF H1617  28.24 
 
 
270 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2737  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  43.9  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.683361 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  26.34 
 
 
276 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  25.43 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1882  hypothetical protein  23.68 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>