15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0714 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  593  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0513  hypothetical protein  78.31 
 
 
278 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.891131  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1417  hypothetical protein  51.57 
 
 
259 aa  275  6e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1150  hypothetical protein  50.39 
 
 
259 aa  262  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  48.66 
 
 
266 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3348  hypothetical protein  50.59 
 
 
260 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0067  hypothetical protein  41.92 
 
 
261 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0645  hypothetical protein  69.81 
 
 
164 aa  157  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.881182  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4887  hypothetical protein  35.02 
 
 
275 aa  125  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4514  hypothetical protein  27.66 
 
 
286 aa  109  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0969  hypothetical protein  31.67 
 
 
271 aa  90.1  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  24.82 
 
 
276 aa  49.7  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3119  hypothetical protein  24.46 
 
 
276 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  32.54 
 
 
276 aa  46.6  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4909  transcriptional regulator protein-like protein  25.21 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>