11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4514 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4514  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0969  hypothetical protein  36.76 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3348  hypothetical protein  34.03 
 
 		 260 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  32.38 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  27.66 
 
 		 286 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1417  hypothetical protein  30.25 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4887  hypothetical protein  32.87 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1150  hypothetical protein  28.81 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0067  hypothetical protein  29.87 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0513  hypothetical protein  26.53 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.891131  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0645  hypothetical protein  30.34 
 
 		 164 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.881182  normal  0.484596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>