More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2481 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 706 aa  1435    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  32.64 
 
 		 698 aa  398  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  33.19 
 
 		 696 aa  398  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  35.75 
 
 		 715 aa  372  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  42.45 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  41.63 
 
 		 493 aa  353  5.9999999999999994e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  41.51 
 
 		 492 aa  351  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  30.77 
 
 		 707 aa  349  9e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  40.08 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  39.87 
 
 		 489 aa  336  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  33.66 
 
 		 706 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  30.1 
 
 		 732 aa  301  4e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  29.6 
 
 		 744 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  30.04 
 
 		 453 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  32.79 
 
 		 1065 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  32.79 
 
 		 1065 aa  159  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  27.34 
 
 		 385 aa  142  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  27.53 
 
 		 464 aa  134  5e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3178  type III restriction protein res subunit  36.9 
 
 		 249 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  30.48 
 
 		 449 aa  124  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  27.38 
 
 		 440 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  27.84 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  30.66 
 
 		 468 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  26.65 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  26.29 
 
 		 531 aa  115  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  25.58 
 
 		 494 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  28.41 
 
 		 551 aa  111  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  27.79 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  28.61 
 
 		 444 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  26.39 
 
 		 590 aa  109  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 509 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  27.27 
 
 		 451 aa  107  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  28.86 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  26.07 
 
 		 517 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  28.01 
 
 		 444 aa  103  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  26.05 
 
 		 466 aa  103  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  26.72 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 479 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0451  DNA repair helicase  28.83 
 
 		 218 aa  101  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000151647 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  24.76 
 
 		 462 aa  100  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  28.02 
 
 		 479 aa  99.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  28.12 
 
 		 443 aa  99.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  27.82 
 
 		 456 aa  99  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.95 
 
 		 633 aa  95.9  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  27.46 
 
 		 466 aa  95.5  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  27.62 
 
 		 451 aa  95.5  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.31 
 
 		 654 aa  95.1  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  28.34 
 
 		 451 aa  94.7  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  24.85 
 
 		 652 aa  94.7  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  28.31 
 
 		 951 aa  92  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  25.81 
 
 		 531 aa  90.5  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  27.87 
 
 		 451 aa  89.7  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  22.97 
 
 		 1052 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  25.19 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  22.58 
 
 		 1061 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  23.28 
 
 		 953 aa  77.4  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  23.28 
 
 		 953 aa  77.4  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  24.44 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  26.2 
 
 		 574 aa  75.1  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  25.11 
 
 		 1418 aa  72.4  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  23.13 
 
 		 1043 aa  72.4  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4288  type III restriction protein res subunit  25.87 
 
 		 1058 aa  71.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  25.29 
 
 		 601 aa  71.2  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  25.74 
 
 		 622 aa  71.2  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  21.7 
 
 		 1051 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  26.84 
 
 		 1348 aa  71.2  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  25.19 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 1033 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  22.42 
 
 		 993 aa  69.7  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0358  type III restriction protein res subunit  21.6 
 
 		 843 aa  69.7  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421793  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  25.38 
 
 		 586 aa  69.7  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  26.1 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  27.05 
 
 		 922 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.44 
 
 		 593 aa  68.9  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  22.95 
 
 		 1077 aa  68.9  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  24.64 
 
 		 629 aa  68.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  25.63 
 
 		 1033 aa  68.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  26.79 
 
 		 848 aa  68.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  22.69 
 
 		 949 aa  67.8  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  24.47 
 
 		 566 aa  67.8  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  24.17 
 
 		 591 aa  67.4  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  24.44 
 
 		 815 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  22.18 
 
 		 982 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  22.24 
 
 		 905 aa  66.6  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  23.92 
 
 		 593 aa  66.2  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  22.85 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  22.34 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  24.17 
 
 		 582 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  24.14 
 
 		 952 aa  65.9  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  24.83 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4457  EcoEI R domain protein  23.64 
 
 		 771 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  22.85 
 
 		 1055 aa  65.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  22.4 
 
 		 813 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  22.58 
 
 		 1017 aa  64.7  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  22.54 
 
 		 1062 aa  64.3  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  25.59 
 
 		 589 aa  63.9  0.000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0344  type I restriction-modification system, R subunit  26.16 
 
 		 770 aa  63.9  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000108762  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  22.69 
 
 		 1063 aa  63.9  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  23.72 
 
 		 1029 aa  63.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>