91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4538 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.7 
 
 		 589 aa  656    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  58.95 
 
 		 626 aa  640    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  59.93 
 
 		 622 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  68.72 
 
 		 577 aa  750    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  59.23 
 
 		 574 aa  647    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  68.96 
 
 		 575 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  60.18 
 
 		 560 aa  647    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  60.97 
 
 		 566 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  60.57 
 
 		 572 aa  666    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  58 
 
 		 599 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  60.36 
 
 		 560 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.21 
 
 		 592 aa  697    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  61.54 
 
 		 595 aa  675    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  60.61 
 
 		 586 aa  642    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  61.03 
 
 		 563 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 565 aa  1138    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  59.36 
 
 		 593 aa  640    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  60.36 
 
 		 560 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  59.82 
 
 		 582 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.44 
 
 		 593 aa  625  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.45 
 
 		 606 aa  615  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  57.25 
 
 		 621 aa  613  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  59.13 
 
 		 601 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  57.68 
 
 		 618 aa  612  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  57.78 
 
 		 601 aa  609  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  57.09 
 
 		 574 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  55.85 
 
 		 593 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  57.17 
 
 		 598 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  57.58 
 
 		 628 aa  598  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  55.32 
 
 		 606 aa  593  1e-168  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  55.48 
 
 		 591 aa  595  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  57.37 
 
 		 569 aa  589  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  48.42 
 
 		 594 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  48.08 
 
 		 583 aa  458  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  45.53 
 
 		 598 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  39.36 
 
 		 559 aa  342  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  31.9 
 
 		 477 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  31.8 
 
 		 464 aa  146  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  29.72 
 
 		 469 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  30.87 
 
 		 472 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  30.87 
 
 		 472 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  29.41 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  29.41 
 
 		 471 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  29.14 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  28.87 
 
 		 465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  28.34 
 
 		 466 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  28.72 
 
 		 465 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  32.19 
 
 		 466 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  27.46 
 
 		 469 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  28.95 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  28.12 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  29.69 
 
 		 458 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  30.29 
 
 		 456 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  30.6 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  26.13 
 
 		 470 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  29.89 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  30 
 
 		 438 aa  98.6  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 601 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 608 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  27.92 
 
 		 622 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  24.08 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  25.49 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  23.79 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  24.63 
 
 		 706 aa  62  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  25.45 
 
 		 1113 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  25.65 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  21.45 
 
 		 707 aa  57.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  21.46 
 
 		 732 aa  54.7  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  27.88 
 
 		 464 aa  53.9  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  22.65 
 
 		 531 aa  53.5  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  21.85 
 
 		 715 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 968 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  23.87 
 
 		 912 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  23.3 
 
 		 385 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0355  type III restriction enzyme, res subunit  22.8 
 
 		 596 aa  48.5  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.098863  normal  0.390536 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  25.13 
 
 		 443 aa  47.8  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  25.71 
 
 		 815 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  23.32 
 
 		 951 aa  47  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  24.74 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  19.32 
 
 		 698 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  32.63 
 
 		 949 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  30.21 
 
 		 949 aa  45.4  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  27.51 
 
 		 950 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  23.45 
 
 		 462 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  19.95 
 
 		 696 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1590  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.81 
 
 		 455 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  30.25 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  25.34 
 
 		 1077 aa  44.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  22.98 
 
 		 995 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>