108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1051 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  62.15 
 
 		 574 aa  669    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  61.81 
 
 		 569 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  68.38 
 
 		 591 aa  785    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  63.46 
 
 		 598 aa  691    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  60.29 
 
 		 566 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  59.93 
 
 		 574 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  61.39 
 
 		 622 aa  659    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  58.77 
 
 		 563 aa  647    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  63.54 
 
 		 586 aa  708    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  76.17 
 
 		 601 aa  898    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  69.59 
 
 		 593 aa  805    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  71.77 
 
 		 618 aa  847    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  67.47 
 
 		 606 aa  761    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  62.42 
 
 		 599 aa  716    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.21 
 
 		 592 aa  653    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  64.76 
 
 		 589 aa  746    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  67.5 
 
 		 606 aa  777    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  75.39 
 
 		 621 aa  882    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  60.78 
 
 		 595 aa  662    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  61.98 
 
 		 593 aa  710    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  79.56 
 
 		 593 aa  932    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 628 aa  1251    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  64.4 
 
 		 582 aa  747    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  59.18 
 
 		 560 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  59.18 
 
 		 560 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  59.18 
 
 		 560 aa  632  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  59.01 
 
 		 572 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  56.58 
 
 		 626 aa  625  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  57.58 
 
 		 565 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  60.34 
 
 		 601 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  58.07 
 
 		 577 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  58.63 
 
 		 575 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  49.5 
 
 		 598 aa  485  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  49.65 
 
 		 594 aa  469  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  48.01 
 
 		 583 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  40.81 
 
 		 559 aa  358  1.9999999999999998e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  32.73 
 
 		 477 aa  185  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  31.5 
 
 		 469 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  31.42 
 
 		 472 aa  163  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  31.42 
 
 		 472 aa  163  9e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  30.79 
 
 		 469 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  31.06 
 
 		 471 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  31.06 
 
 		 471 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  29.97 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  29.97 
 
 		 465 aa  150  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  30.33 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  28.16 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  30 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  31 
 
 		 465 aa  146  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  29.43 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  31.08 
 
 		 458 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  32.8 
 
 		 466 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  28.86 
 
 		 434 aa  137  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  32.55 
 
 		 429 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  27.68 
 
 		 435 aa  104  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  28.29 
 
 		 456 aa  104  6e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  30.4 
 
 		 438 aa  100  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  29.73 
 
 		 601 aa  84  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 608 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  29.02 
 
 		 622 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  23.04 
 
 		 492 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  24.83 
 
 		 706 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  24.17 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25.2 
 
 		 385 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  31.76 
 
 		 1129 aa  58.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  21.38 
 
 		 732 aa  58.5  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  21.13 
 
 		 698 aa  57  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  24.15 
 
 		 706 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  22.58 
 
 		 464 aa  54.7  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  23.02 
 
 		 462 aa  54.7  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  26.35 
 
 		 469 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  24.13 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  25.31 
 
 		 995 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  23.79 
 
 		 907 aa  52  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  21.91 
 
 		 531 aa  51.6  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  30.06 
 
 		 835 aa  50.8  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  24.5 
 
 		 443 aa  50.8  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  24.88 
 
 		 791 aa  50.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1144 aa  50.4  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  25.06 
 
 		 899 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  27.66 
 
 		 489 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.01 
 
 		 951 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  27.66 
 
 		 489 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  23.22 
 
 		 949 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  26.73 
 
 		 1116 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  22.22 
 
 		 809 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  34.13 
 
 		 1131 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  25.52 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  22.69 
 
 		 875 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 607 aa  48.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  25 
 
 		 469 aa  47.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  24.06 
 
 		 585 aa  47.8  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.16 
 
 		 444 aa  47.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  26.38 
 
 		 451 aa  47.4  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  19.64 
 
 		 696 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  24.49 
 
 		 796 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  34.85 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  28.57 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 1597 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  23.26 
 
 		 829 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>