More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2052 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  74.74 
 
 		 493 aa  759    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  66.11 
 
 		 492 aa  647    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  68.43 
 
 		 469 aa  645    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 489 aa  1011    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  99.39 
 
 		 489 aa  1002    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  40.08 
 
 		 706 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  33.26 
 
 		 744 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  32.58 
 
 		 707 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  32.75 
 
 		 715 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  32.39 
 
 		 698 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  32.53 
 
 		 696 aa  203  5e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  32.33 
 
 		 732 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  33.86 
 
 		 706 aa  189  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  29.15 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  28.31 
 
 		 464 aa  136  8e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  27.52 
 
 		 451 aa  119  9e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  27.64 
 
 		 453 aa  116  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  27.83 
 
 		 444 aa  114  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  35.75 
 
 		 453 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  28.47 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  27.52 
 
 		 531 aa  110  8.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  27.49 
 
 		 470 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  26.22 
 
 		 468 aa  107  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  26.65 
 
 		 488 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  27.14 
 
 		 466 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  23.46 
 
 		 652 aa  100  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  27.75 
 
 		 444 aa  99  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  26.98 
 
 		 551 aa  99  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  26.14 
 
 		 479 aa  98.2  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  24.52 
 
 		 449 aa  97.4  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 466 aa  97.1  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  25.95 
 
 		 491 aa  97.1  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  25.24 
 
 		 462 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.97 
 
 		 654 aa  95.9  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  26.15 
 
 		 499 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  28.83 
 
 		 456 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  28.28 
 
 		 647 aa  94  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  27.66 
 
 		 451 aa  91.7  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  28.46 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  23.83 
 
 		 566 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 451 aa  87  6e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  27.59 
 
 		 517 aa  86.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  25.88 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.49 
 
 		 951 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  25.88 
 
 		 509 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  24.39 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  26.1 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  23.77 
 
 		 574 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  24.27 
 
 		 630 aa  83.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  25.12 
 
 		 590 aa  83.2  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  24.23 
 
 		 666 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  24.6 
 
 		 592 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 574 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  26.28 
 
 		 650 aa  80.5  0.00000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.3 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.75 
 
 		 633 aa  80.5  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  26.8 
 
 		 1033 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  23.34 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  25.4 
 
 		 626 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  23.34 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  23.34 
 
 		 560 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  26.05 
 
 		 1033 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  24.57 
 
 		 563 aa  77.4  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  26.15 
 
 		 569 aa  76.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  25.69 
 
 		 658 aa  76.6  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 565 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  23.72 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  23.59 
 
 		 586 aa  74.3  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 		 649 aa  74.3  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  25.15 
 
 		 949 aa  74.7  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  23.85 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  25.88 
 
 		 593 aa  73.6  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  24.81 
 
 		 629 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  24.33 
 
 		 643 aa  72  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  24.2 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  26.28 
 
 		 479 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  24.01 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  25.38 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  24.67 
 
 		 1052 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  24.54 
 
 		 1029 aa  70.5  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  23.62 
 
 		 582 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  26.92 
 
 		 886 aa  70.1  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  23.37 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  24.28 
 
 		 601 aa  68.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 583 aa  68.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  22.08 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  23.53 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  24.87 
 
 		 590 aa  67.8  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  24.12 
 
 		 595 aa  67.4  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1910  type III restriction enzyme, res subunit  25.79 
 
 		 1043 aa  67.4  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  24.19 
 
 		 1062 aa  67.4  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  25.38 
 
 		 982 aa  67  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  23.76 
 
 		 593 aa  67  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  23.51 
 
 		 622 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 1055 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  26.24 
 
 		 949 aa  66.2  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 1055 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  25.38 
 
 		 1055 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  22.59 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>