153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0197 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 429 aa  887    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  61.21 
 
 		 465 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  46.08 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  49.45 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  49.18 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  50.42 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  50.42 
 
 		 471 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  49.3 
 
 		 470 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  48.14 
 
 		 466 aa  360  4e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  50.14 
 
 		 469 aa  355  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  49.46 
 
 		 472 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  49.46 
 
 		 472 aa  350  2e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  42.11 
 
 		 469 aa  350  4e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  49.31 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  46.89 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  48.19 
 
 		 477 aa  341  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  46.13 
 
 		 458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  41.85 
 
 		 434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  31.37 
 
 		 599 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  33.04 
 
 		 593 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  33.76 
 
 		 559 aa  136  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  31.43 
 
 		 582 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.94 
 
 		 593 aa  136  9e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.79 
 
 		 606 aa  129  7.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  30.68 
 
 		 586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  31.12 
 
 		 622 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  28.91 
 
 		 595 aa  126  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  29.72 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  34.28 
 
 		 621 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.77 
 
 		 606 aa  124  5e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  26.73 
 
 		 574 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.62 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  32.49 
 
 		 566 aa  121  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  30.46 
 
 		 569 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  30.41 
 
 		 593 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  32.62 
 
 		 626 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  30.32 
 
 		 563 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.86 
 
 		 592 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  32.55 
 
 		 628 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 		 601 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  29.55 
 
 		 574 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  30.46 
 
 		 598 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  33.33 
 
 		 572 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  29.97 
 
 		 618 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  31.48 
 
 		 601 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  29.89 
 
 		 565 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  30.82 
 
 		 560 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  30.82 
 
 		 560 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  30.82 
 
 		 560 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  30.79 
 
 		 575 aa  105  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  30.21 
 
 		 577 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  30.45 
 
 		 583 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  28.48 
 
 		 594 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  41.43 
 
 		 139 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  41.43 
 
 		 139 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  28.62 
 
 		 435 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  27.34 
 
 		 456 aa  89.7  9e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  26.79 
 
 		 598 aa  87  6e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  27.86 
 
 		 438 aa  86.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  24.59 
 
 		 676 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  25.09 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  25.09 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  24.18 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  23.08 
 
 		 967 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  24.54 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  24.18 
 
 		 580 aa  57  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  24.62 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  24.36 
 
 		 463 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  23.1 
 
 		 946 aa  55.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  23.05 
 
 		 1141 aa  55.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  24.47 
 
 		 952 aa  54.7  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  22.5 
 
 		 585 aa  54.7  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  27.04 
 
 		 616 aa  53.1  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  23.08 
 
 		 987 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  28.12 
 
 		 583 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  25.99 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  26.25 
 
 		 590 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  22.48 
 
 		 993 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  24.24 
 
 		 479 aa  51.2  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  31.43 
 
 		 583 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0803  type III restriction enzyme, res subunit  28.57 
 
 		 1137 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.874877  normal  0.710753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  25.85 
 
 		 494 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  23.68 
 
 		 531 aa  51.2  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  22.19 
 
 		 905 aa  50.4  0.00005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5882  helicase domain protein  30.21 
 
 		 1169 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  26.77 
 
 		 657 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  27.34 
 
 		 583 aa  50.4  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  29.17 
 
 		 953 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  29.17 
 
 		 953 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  21.59 
 
 		 586 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2747  type I restriction-modification system, R subunit  30.93 
 
 		 934 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.504328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  25.61 
 
 		 588 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  21.59 
 
 		 586 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  21.59 
 
 		 586 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  21.59 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  22.33 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  22.88 
 
 		 586 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  25.62 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  25 
 
 		 1115 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  25.62 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>