120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2588 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  61.35 
 
 		 569 aa  666    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 591 aa  1202    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  61.88 
 
 		 574 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  64.03 
 
 		 582 aa  739    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  62.37 
 
 		 598 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  67.35 
 
 		 601 aa  796    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  59.68 
 
 		 566 aa  651    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  67.35 
 
 		 606 aa  776    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  60.22 
 
 		 574 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.63 
 
 		 592 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  61.82 
 
 		 589 aa  726    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  60.68 
 
 		 622 aa  652    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  57.8 
 
 		 595 aa  638    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  68.5 
 
 		 621 aa  801    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  68.38 
 
 		 628 aa  770    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  60.97 
 
 		 593 aa  722    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  92.07 
 
 		 593 aa  1120    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  62.67 
 
 		 586 aa  712    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  68.1 
 
 		 618 aa  794    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  72.82 
 
 		 606 aa  855    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  68.91 
 
 		 593 aa  803    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  59.39 
 
 		 599 aa  689    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  58.27 
 
 		 563 aa  632  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  58.09 
 
 		 560 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  58.09 
 
 		 560 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  58.09 
 
 		 560 aa  628  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  56.91 
 
 		 626 aa  623  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  57.54 
 
 		 572 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  59.49 
 
 		 601 aa  598  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  55.85 
 
 		 577 aa  595  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  55.48 
 
 		 565 aa  595  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  56.22 
 
 		 575 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  48.47 
 
 		 598 aa  487  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  48.28 
 
 		 583 aa  475  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  48.34 
 
 		 594 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  40.85 
 
 		 559 aa  346  6e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  32.57 
 
 		 477 aa  194  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  29.11 
 
 		 469 aa  171  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  30.63 
 
 		 472 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  30.63 
 
 		 472 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  29.77 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  29.25 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  29 
 
 		 465 aa  157  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  28.79 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  28.79 
 
 		 471 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  29.44 
 
 		 465 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  31.53 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  28.1 
 
 		 471 aa  151  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  28.68 
 
 		 458 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  31.65 
 
 		 464 aa  150  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  30.22 
 
 		 434 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  27.53 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  28.01 
 
 		 470 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  29.72 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  28.04 
 
 		 456 aa  113  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  27.72 
 
 		 435 aa  103  9e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  29.31 
 
 		 438 aa  99.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  27.31 
 
 		 601 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  28.67 
 
 		 622 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 608 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  22.22 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  23.2 
 
 		 707 aa  72.4  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  24.17 
 
 		 706 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25.58 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  24.21 
 
 		 1093 aa  57  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  26.4 
 
 		 492 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  24.48 
 
 		 444 aa  55.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  22.47 
 
 		 715 aa  55.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  24.15 
 
 		 558 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  26.78 
 
 		 489 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  26.78 
 
 		 489 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  19.57 
 
 		 698 aa  54.3  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 629 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  26.25 
 
 		 440 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  23.23 
 
 		 602 aa  51.6  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  21.84 
 
 		 696 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  25.35 
 
 		 995 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  27.23 
 
 		 464 aa  51.2  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  23.85 
 
 		 907 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  23.39 
 
 		 590 aa  50.8  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  24.53 
 
 		 590 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  23.14 
 
 		 443 aa  50.8  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  24.86 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  24.94 
 
 		 462 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  24.41 
 
 		 586 aa  50.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  23.79 
 
 		 584 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  23.67 
 
 		 584 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  23.18 
 
 		 584 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  23.14 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1131 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  26.28 
 
 		 444 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  23.3 
 
 		 584 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  23.02 
 
 		 787 aa  48.5  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  22.25 
 
 		 551 aa  48.1  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  23.77 
 
 		 590 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  23.62 
 
 		 591 aa  47.4  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  31.33 
 
 		 451 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  23.5 
 
 		 791 aa  47  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  32.31 
 
 		 491 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  25.81 
 
 		 949 aa  46.2  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>