121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08571 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 438 aa  888    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  68.26 
 
 		 435 aa  589  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  68.11 
 
 		 456 aa  586  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  33.6 
 
 		 559 aa  137  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.68 
 
 		 606 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  32.31 
 
 		 593 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  31.51 
 
 		 618 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  31.17 
 
 		 563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  30.31 
 
 		 577 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.89 
 
 		 589 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  29.47 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  30.31 
 
 		 575 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  27.33 
 
 		 434 aa  110  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  29.43 
 
 		 626 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  29.16 
 
 		 586 aa  105  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  30.31 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 599 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  29.82 
 
 		 593 aa  103  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  29.61 
 
 		 595 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  26.38 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.49 
 
 		 606 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  30.23 
 
 		 582 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  28.45 
 
 		 574 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  30.33 
 
 		 569 aa  99.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  29.31 
 
 		 591 aa  99.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.53 
 
 		 592 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  30 
 
 		 565 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  26.17 
 
 		 465 aa  98.2  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  28.91 
 
 		 560 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  28.91 
 
 		 560 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  28.91 
 
 		 560 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.03 
 
 		 593 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  27.08 
 
 		 566 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  29.83 
 
 		 622 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  22.76 
 
 		 466 aa  94  5e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  29.91 
 
 		 628 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  27.75 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  28.65 
 
 		 594 aa  91.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  31.34 
 
 		 572 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  28.07 
 
 		 601 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  29.34 
 
 		 621 aa  90.1  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  25.45 
 
 		 477 aa  90.1  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  26.01 
 
 		 471 aa  89.7  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  26.97 
 
 		 472 aa  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  26.97 
 
 		 472 aa  89.7  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  25.17 
 
 		 465 aa  89.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  25.47 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  25.47 
 
 		 471 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  26.51 
 
 		 466 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  25.17 
 
 		 465 aa  87.8  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  27.86 
 
 		 429 aa  86.7  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  24.86 
 
 		 464 aa  86.3  9e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  27.27 
 
 		 583 aa  84  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  27.61 
 
 		 601 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  24.53 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  26.21 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  25.42 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  38.4 
 
 		 598 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0449  type III restriction enzyme, res subunit  23.78 
 
 		 1062 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.457161  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  27.12 
 
 		 622 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.57 
 
 		 608 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  28.46 
 
 		 676 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  23.65 
 
 		 899 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  25.09 
 
 		 586 aa  52.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  27.51 
 
 		 580 aa  52.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  20.43 
 
 		 905 aa  50.8  0.00004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  27.65 
 
 		 609 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  23.48 
 
 		 586 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  22.78 
 
 		 586 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  21.66 
 
 		 1065 aa  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  22.93 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  22.93 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  27.31 
 
 		 579 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  22.93 
 
 		 586 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  22.93 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  22.93 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  22.93 
 
 		 586 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  29.41 
 
 		 590 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  23.76 
 
 		 1061 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  22.68 
 
 		 586 aa  47.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  28.43 
 
 		 590 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  23.69 
 
 		 899 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1001  superfamily II DNA/RNA helicase  23.24 
 
 		 773 aa  47  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  25.69 
 
 		 1033 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  28.43 
 
 		 590 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  20.28 
 
 		 584 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.75 
 
 		 580 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  22.76 
 
 		 586 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  28.43 
 
 		 590 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  23.67 
 
 		 597 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  22.04 
 
 		 657 aa  45.8  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  22.76 
 
 		 586 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  22.76 
 
 		 586 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  23.33 
 
 		 586 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1359  helicase, putative  23.25 
 
 		 1041 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  23.31 
 
 		 586 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  22.76 
 
 		 586 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  25.07 
 
 		 1033 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  28.77 
 
 		 1069 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  23.18 
 
 		 1055 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>