107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0881 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  61.58 
 
 		 569 aa  664    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  60.68 
 
 		 574 aa  666    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  68.5 
 
 		 591 aa  801    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  62.2 
 
 		 598 aa  694    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  58.51 
 
 		 566 aa  637    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  60.21 
 
 		 622 aa  643    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  62.07 
 
 		 586 aa  697    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  68.61 
 
 		 593 aa  813    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  66.88 
 
 		 618 aa  805    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  69.02 
 
 		 606 aa  797    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  60.98 
 
 		 599 aa  719    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  72.97 
 
 		 601 aa  868    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  64.01 
 
 		 589 aa  758    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  64.64 
 
 		 606 aa  756    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 621 aa  1253    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  59.04 
 
 		 595 aa  654    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  61.51 
 
 		 593 aa  715    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  80.24 
 
 		 593 aa  942    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  72.6 
 
 		 628 aa  879    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  62.33 
 
 		 582 aa  717    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  58.33 
 
 		 574 aa  633  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.79 
 
 		 592 aa  633  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  58.23 
 
 		 563 aa  630  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  56.79 
 
 		 572 aa  613  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  57.25 
 
 		 565 aa  615  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  56.6 
 
 		 560 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  56.6 
 
 		 560 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  56.6 
 
 		 560 aa  597  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  57.93 
 
 		 601 aa  592  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  54.11 
 
 		 626 aa  594  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  55.42 
 
 		 577 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  55.44 
 
 		 575 aa  568  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  49.92 
 
 		 598 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  48.71 
 
 		 583 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  48.58 
 
 		 594 aa  461  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  40.64 
 
 		 559 aa  355  1e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  32.7 
 
 		 477 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  33.15 
 
 		 464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  31.41 
 
 		 469 aa  164  6e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  30.25 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  31.91 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  31.91 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  29.19 
 
 		 465 aa  156  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  29.7 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 458 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  28.17 
 
 		 466 aa  147  6e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 471 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  29.1 
 
 		 471 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  30.56 
 
 		 466 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  28.69 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  30.29 
 
 		 465 aa  144  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  28.03 
 
 		 471 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  29.67 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  34.28 
 
 		 429 aa  124  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  30.92 
 
 		 456 aa  97.8  5e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  29.34 
 
 		 435 aa  93.2  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  29.34 
 
 		 438 aa  90.1  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.42 
 
 		 608 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  29.05 
 
 		 601 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  28.03 
 
 		 622 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  24.2 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25.26 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  25.51 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  24.14 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  24.34 
 
 		 706 aa  60.8  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  25.92 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  22.14 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  20.13 
 
 		 698 aa  60.1  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  23.94 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  23.67 
 
 		 492 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  23.72 
 
 		 491 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  23.33 
 
 		 558 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  23.83 
 
 		 440 aa  54.3  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  20.04 
 
 		 715 aa  54.3  0.000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 494 aa  54.3  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  26.28 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  23.82 
 
 		 462 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  26.34 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  22.69 
 
 		 1137 aa  50.8  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.33 
 
 		 444 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  30.48 
 
 		 949 aa  49.7  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  21.36 
 
 		 696 aa  49.7  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  27.88 
 
 		 949 aa  48.9  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  20.73 
 
 		 707 aa  48.9  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  23.59 
 
 		 444 aa  48.9  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  23.53 
 
 		 706 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  22.44 
 
 		 1137 aa  48.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  22.44 
 
 		 1137 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  27.45 
 
 		 952 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  26.59 
 
 		 469 aa  47.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  22.14 
 
 		 796 aa  47.4  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  24.38 
 
 		 1093 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  27.45 
 
 		 953 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  27.45 
 
 		 953 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.27 
 
 		 499 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  24.59 
 
 		 509 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  24.8 
 
 		 995 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  23.15 
 
 		 875 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  24.59 
 
 		 509 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  22.62 
 
 		 907 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>