139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1979 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  77.7 
 
 		 456 aa  663    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  877    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  68.26 
 
 		 438 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  32.06 
 
 		 563 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  31.39 
 
 		 595 aa  139  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  30.52 
 
 		 574 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  31.87 
 
 		 559 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  30.37 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  30.34 
 
 		 626 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  30.47 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  30.47 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  30.47 
 
 		 560 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  28.06 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  29.2 
 
 		 574 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.38 
 
 		 592 aa  122  9e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  29.36 
 
 		 593 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  30.69 
 
 		 598 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  28.98 
 
 		 599 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  29.18 
 
 		 618 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  30.3 
 
 		 577 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.31 
 
 		 606 aa  118  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  29.7 
 
 		 582 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  30.6 
 
 		 565 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.48 
 
 		 593 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  29.31 
 
 		 466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.1 
 
 		 589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  26.05 
 
 		 469 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  27.48 
 
 		 477 aa  113  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  28.68 
 
 		 586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  28.79 
 
 		 569 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  29.31 
 
 		 575 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  27.48 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  27.48 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.19 
 
 		 606 aa  107  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  29.06 
 
 		 594 aa  106  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  25.46 
 
 		 471 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  25.46 
 
 		 471 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  27.86 
 
 		 593 aa  106  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  24.81 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  26.56 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  30.21 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  27.55 
 
 		 601 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  27.72 
 
 		 591 aa  103  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  26.3 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  29.35 
 
 		 622 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  24.94 
 
 		 464 aa  99  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  27.68 
 
 		 628 aa  97.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  25.84 
 
 		 465 aa  97.1  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  25.71 
 
 		 465 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  29.04 
 
 		 583 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  28.62 
 
 		 429 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  22.91 
 
 		 466 aa  94.7  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  29.68 
 
 		 598 aa  94  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  29.34 
 
 		 621 aa  93.6  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  29.18 
 
 		 601 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  23.76 
 
 		 470 aa  90.5  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  22.82 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3695  putative helicase  24.81 
 
 		 676 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.783104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  27.01 
 
 		 622 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  22.28 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  22.28 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  22.54 
 
 		 586 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  22.54 
 
 		 586 aa  57  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  23.91 
 
 		 585 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  22.19 
 
 		 597 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  21.52 
 
 		 586 aa  55.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  23.29 
 
 		 899 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  23.91 
 
 		 585 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  23.91 
 
 		 585 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  23.79 
 
 		 586 aa  54.7  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  21.91 
 
 		 586 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  22.14 
 
 		 585 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  22.28 
 
 		 586 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  26.15 
 
 		 456 aa  53.9  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  23.36 
 
 		 588 aa  53.5  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  22.84 
 
 		 586 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  23.71 
 
 		 586 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  20.65 
 
 		 583 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  22.88 
 
 		 586 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  23.97 
 
 		 601 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  22.88 
 
 		 586 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  23.72 
 
 		 586 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0822  DEAD/DEAH box helicase-like  23.5 
 
 		 1065 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.317818  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3869  type III restriction enzyme, res subunit  25.9 
 
 		 1033 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  23.45 
 
 		 586 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  23.45 
 
 		 586 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  28.33 
 
 		 583 aa  50.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  23.45 
 
 		 586 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  23.45 
 
 		 586 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  23.45 
 
 		 586 aa  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4011  type III restriction protein res subunit  25.62 
 
 		 1033 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  23.31 
 
 		 1061 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  21.91 
 
 		 657 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  22.63 
 
 		 1133 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2205  type III restriction protein res subunit  20.9 
 
 		 993 aa  48.9  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.93 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  19.75 
 
 		 583 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0432  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 619 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3182  type III restriction protein res subunit  22.97 
 
 		 1029 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  23.13 
 
 		 606 aa  47.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>