92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4526 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  100 
 
 
559 aa  1130    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  42.64 
 
 
622 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  42.24 
 
 
606 aa  366  1e-100  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  40.49 
 
 
593 aa  360  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  42.01 
 
 
618 aa  360  5e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  41.64 
 
 
560 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  41.64 
 
 
560 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  41.36 
 
 
592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  40.92 
 
 
593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  41.45 
 
 
560 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  40.88 
 
 
621 aa  356  6.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  40.24 
 
 
589 aa  354  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  42.02 
 
 
595 aa  355  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  40.46 
 
 
601 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  39.36 
 
 
582 aa  349  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  40.85 
 
 
591 aa  348  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  40.7 
 
 
586 aa  347  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  39.86 
 
 
606 aa  347  4e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  40.95 
 
 
628 aa  347  4e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  41.06 
 
 
566 aa  346  7e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  39.39 
 
 
563 aa  345  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  39.64 
 
 
565 aa  345  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  38.55 
 
 
599 aa  337  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  39.58 
 
 
574 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  39.82 
 
 
574 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  39.48 
 
 
572 aa  330  4e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  40.38 
 
 
601 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  38.79 
 
 
593 aa  327  3e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  39.86 
 
 
598 aa  326  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  38.76 
 
 
626 aa  323  7e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  41.15 
 
 
577 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  41.81 
 
 
575 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  39.47 
 
 
569 aa  318  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  42.42 
 
 
594 aa  292  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  36.64 
 
 
583 aa  289  8e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  35.59 
 
 
598 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  30.59 
 
 
477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  32.07 
 
 
471 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  32.07 
 
 
471 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  31.81 
 
 
464 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  31.31 
 
 
471 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  31.79 
 
 
469 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  31.82 
 
 
465 aa  160  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  30.65 
 
 
469 aa  157  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  31.31 
 
 
465 aa  156  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  31.74 
 
 
472 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  31.74 
 
 
472 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  33.42 
 
 
465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  30.23 
 
 
466 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  29.34 
 
 
466 aa  151  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  29.31 
 
 
470 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  33.6 
 
 
438 aa  138  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  33.76 
 
 
429 aa  136  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  29.41 
 
 
434 aa  133  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  28.35 
 
 
458 aa  131  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  31.87 
 
 
435 aa  131  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  32.12 
 
 
456 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  27.83 
 
 
601 aa  92  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  28.42 
 
 
622 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.83 
 
 
608 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  24.83 
 
 
706 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  26.22 
 
 
995 aa  57.4  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  29.11 
 
 
385 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  28.05 
 
 
1597 aa  52  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  26.06 
 
 
1113 aa  51.6  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  23.61 
 
 
590 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  25.69 
 
 
464 aa  51.2  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  24.87 
 
 
494 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  23.99 
 
 
907 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1416  EcoEI R domain protein  22.79 
 
 
800 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  23.18 
 
 
765 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  21.85 
 
 
489 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  21.85 
 
 
489 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  24.77 
 
 
558 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  20.82 
 
 
493 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  20.28 
 
 
698 aa  48.1  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  23.06 
 
 
590 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  22.97 
 
 
469 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  21.93 
 
 
809 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  23.88 
 
 
715 aa  46.2  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  24.4 
 
 
652 aa  46.2  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  23.41 
 
 
813 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  23.26 
 
 
440 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  23.08 
 
 
580 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  23.06 
 
 
590 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  25.35 
 
 
1093 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  20.72 
 
 
827 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  23.35 
 
 
580 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  21.31 
 
 
499 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  22.75 
 
 
492 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  20.57 
 
 
491 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  23.86 
 
 
444 aa  44.3  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>