96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12931 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  65.84 
 
 		 572 aa  727    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  60.63 
 
 		 622 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  59.86 
 
 		 586 aa  636    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  66.31 
 
 		 563 aa  733    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  74.29 
 
 		 560 aa  830    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  58.95 
 
 		 565 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  100 
 
 		 626 aa  1262    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  68.29 
 
 		 595 aa  773    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  56.27 
 
 		 599 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  74.46 
 
 		 560 aa  833    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  74.46 
 
 		 560 aa  833    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  76.25 
 
 		 574 aa  867    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  76.87 
 
 		 566 aa  876    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  65.19 
 
 		 592 aa  758    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  58.81 
 
 		 577 aa  634  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  56.36 
 
 		 582 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  59.37 
 
 		 575 aa  629  1e-179  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  58.13 
 
 		 601 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  57.5 
 
 		 618 aa  628  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.61 
 
 		 589 aa  627  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.84 
 
 		 593 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  56.91 
 
 		 591 aa  623  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  56.69 
 
 		 593 aa  623  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  56.38 
 
 		 593 aa  622  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  56.57 
 
 		 598 aa  617  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  54.3 
 
 		 606 aa  616  1e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  56.58 
 
 		 628 aa  615  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  56.45 
 
 		 574 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  55.26 
 
 		 606 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  58.33 
 
 		 601 aa  598  1e-169  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  54.11 
 
 		 621 aa  594  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  55.81 
 
 		 569 aa  590  1e-167  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  47.23 
 
 		 594 aa  460  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  46.48 
 
 		 598 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  46.26 
 
 		 583 aa  452  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  38.65 
 
 		 559 aa  320  7e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  31.19 
 
 		 477 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  30.69 
 
 		 469 aa  170  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  32.16 
 
 		 464 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  29.74 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  30.51 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  31.03 
 
 		 471 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  31.03 
 
 		 471 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  28.86 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  28.86 
 
 		 472 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  27.57 
 
 		 466 aa  146  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  30.05 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  30.65 
 
 		 465 aa  144  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  29.78 
 
 		 466 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  29.52 
 
 		 465 aa  138  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  30.34 
 
 		 435 aa  131  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  30.81 
 
 		 456 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  27.82 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  25.96 
 
 		 434 aa  128  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  26.57 
 
 		 470 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  32.62 
 
 		 429 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  29.43 
 
 		 438 aa  108  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  28.4 
 
 		 622 aa  90.9  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  27.91 
 
 		 608 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  33.18 
 
 		 601 aa  83.6  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  25.4 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  25.4 
 
 		 489 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  24.84 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  23.17 
 
 		 469 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  23.96 
 
 		 558 aa  68.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  24.66 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  25.76 
 
 		 385 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  21.77 
 
 		 698 aa  59.3  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  24.32 
 
 		 1116 aa  55.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  25.76 
 
 		 899 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  24.32 
 
 		 462 aa  54.3  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  24.73 
 
 		 444 aa  53.9  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  22.33 
 
 		 696 aa  53.5  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  23.72 
 
 		 932 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  25.45 
 
 		 440 aa  52  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  23.72 
 
 		 932 aa  52.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  22.31 
 
 		 551 aa  51.6  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.42 
 
 		 951 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  23.51 
 
 		 443 aa  49.7  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  29.82 
 
 		 706 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  21.67 
 
 		 715 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  24.21 
 
 		 494 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  20.68 
 
 		 744 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  24.28 
 
 		 995 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  24.55 
 
 		 949 aa  48.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  26.73 
 
 		 949 aa  46.6  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  25.32 
 
 		 444 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.45 
 
 		 633 aa  46.2  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  25.21 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  25.25 
 
 		 531 aa  45.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  29.03 
 
 		 491 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  29.37 
 
 		 649 aa  44.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  22.31 
 
 		 556 aa  44.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  23.58 
 
 		 945 aa  43.9  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  24.25 
 
 		 499 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  24.71 
 
 		 707 aa  43.9  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>