135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3879 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.12 
 
 		 592 aa  700    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  68.61 
 
 		 569 aa  751    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.87 
 
 		 589 aa  702    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  64.54 
 
 		 601 aa  738    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  61.72 
 
 		 601 aa  642    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  71.45 
 
 		 582 aa  856    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  60.97 
 
 		 591 aa  722    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  63.99 
 
 		 618 aa  728    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  62.27 
 
 		 598 aa  720    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  59.61 
 
 		 566 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  72.18 
 
 		 586 aa  832    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.35 
 
 		 606 aa  719    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  59.72 
 
 		 574 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  69.08 
 
 		 574 aa  776    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 593 aa  1196    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  61.98 
 
 		 628 aa  697    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.82 
 
 		 593 aa  724    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  63.12 
 
 		 622 aa  691    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  61.73 
 
 		 621 aa  711    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  59.36 
 
 		 565 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  60.93 
 
 		 599 aa  733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  61.38 
 
 		 563 aa  683    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  61.62 
 
 		 572 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  61.41 
 
 		 595 aa  690    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  63.05 
 
 		 606 aa  728    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  60.47 
 
 		 593 aa  719    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  61.08 
 
 		 577 aa  632  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  57.98 
 
 		 560 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  57.98 
 
 		 560 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  57.98 
 
 		 560 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  56.69 
 
 		 626 aa  623  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  60.77 
 
 		 575 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  48.35 
 
 		 594 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  48.74 
 
 		 598 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  46.55 
 
 		 583 aa  462  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  45.56 
 
 		 559 aa  324  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  32.56 
 
 		 477 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  31.41 
 
 		 469 aa  170  6e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  32.61 
 
 		 464 aa  167  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  30.15 
 
 		 469 aa  166  8e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  31.08 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  31.14 
 
 		 472 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  31.14 
 
 		 472 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  30.56 
 
 		 465 aa  160  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  28.84 
 
 		 471 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  28.84 
 
 		 471 aa  160  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  31.37 
 
 		 465 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  31.62 
 
 		 458 aa  157  8e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  33 
 
 		 466 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  30.61 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  28.93 
 
 		 466 aa  152  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  29.51 
 
 		 434 aa  149  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  28.77 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  33.04 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  30.7 
 
 		 456 aa  127  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  29.36 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  32.31 
 
 		 438 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.95 
 
 		 608 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  27.34 
 
 		 622 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  27.94 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  24.64 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  25.88 
 
 		 489 aa  73.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  27.15 
 
 		 601 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  25.88 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  25.19 
 
 		 706 aa  70.5  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  26.85 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  20.59 
 
 		 698 aa  67  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  23.63 
 
 		 732 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  24.06 
 
 		 558 aa  65.1  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  29.38 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  23.04 
 
 		 464 aa  61.6  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  20.05 
 
 		 696 aa  58.2  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  24.38 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0725  DEAD/DEAH box helicase-like  23.67 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  26.68 
 
 		 479 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  22.91 
 
 		 1137 aa  54.3  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  22.82 
 
 		 531 aa  53.9  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  23.68 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  26.11 
 
 		 652 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  28.25 
 
 		 707 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.93 
 
 		 951 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  25.53 
 
 		 590 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  23.69 
 
 		 468 aa  51.2  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  24.39 
 
 		 907 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3640  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 524 aa  50.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  22.55 
 
 		 809 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2026  type III restriction enzyme, res subunit  23.87 
 
 		 1138 aa  50.4  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476841 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  25.87 
 
 		 1137 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  30.53 
 
 		 949 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  24.3 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  25.3 
 
 		 791 aa  50.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5278  type III restriction protein res subunit  27.56 
 
 		 899 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  22.61 
 
 		 616 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  22.64 
 
 		 583 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  24.11 
 
 		 932 aa  49.7  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  22.4 
 
 		 580 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  23.39 
 
 		 584 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  25.69 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  22.91 
 
 		 584 aa  48.9  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>