113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1477 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  62.46 
 
 		 569 aa  684    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  60.24 
 
 		 601 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  57.57 
 
 		 560 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  61.34 
 
 		 601 aa  707    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  62.42 
 
 		 628 aa  704    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  59.39 
 
 		 591 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  62.31 
 
 		 598 aa  708    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  63.48 
 
 		 586 aa  736    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  57.57 
 
 		 560 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  57.14 
 
 		 566 aa  635    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  57.57 
 
 		 560 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  56.27 
 
 		 626 aa  645    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  61.63 
 
 		 622 aa  689    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  58 
 
 		 565 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  59.9 
 
 		 593 aa  698    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  62.81 
 
 		 582 aa  762    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  62.12 
 
 		 618 aa  715    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.77 
 
 		 606 aa  668    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  58.25 
 
 		 572 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 599 aa  1222    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  57.52 
 
 		 563 aa  660    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.41 
 
 		 592 aa  706    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.36 
 
 		 589 aa  700    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.72 
 
 		 606 aa  689    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  61.09 
 
 		 621 aa  713    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  63.18 
 
 		 574 aa  712    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  59.65 
 
 		 595 aa  678    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  60.93 
 
 		 593 aa  733    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.07 
 
 		 593 aa  704    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  57.32 
 
 		 574 aa  634  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  58.07 
 
 		 577 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  57.57 
 
 		 575 aa  598  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  47.75 
 
 		 594 aa  482  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  45.83 
 
 		 598 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  45.53 
 
 		 583 aa  445  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  38.65 
 
 		 559 aa  329  8e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 472 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  29.86 
 
 		 477 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  30.05 
 
 		 469 aa  174  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  28.5 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  29.66 
 
 		 465 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  28.82 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  29.31 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  29.31 
 
 		 471 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  31.44 
 
 		 464 aa  160  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  30.3 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  27.96 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  28.42 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  26.24 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  28.95 
 
 		 458 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  31.37 
 
 		 429 aa  144  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  30.37 
 
 		 466 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  25.12 
 
 		 470 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  28.98 
 
 		 435 aa  120  7.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  29.9 
 
 		 456 aa  117  6e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 438 aa  103  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  27.19 
 
 		 601 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  27.96 
 
 		 608 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  27.46 
 
 		 622 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  27.01 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  22.71 
 
 		 558 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  22.39 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  20.62 
 
 		 698 aa  62  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  25.51 
 
 		 652 aa  62  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.91 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  24.93 
 
 		 517 aa  57.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  26.63 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  27.42 
 
 		 650 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  25.33 
 
 		 444 aa  55.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  26.97 
 
 		 489 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  26.97 
 
 		 489 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  24.93 
 
 		 654 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  22.94 
 
 		 1137 aa  53.9  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  23.13 
 
 		 796 aa  53.9  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  26.56 
 
 		 462 aa  53.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  23.27 
 
 		 1137 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  23.27 
 
 		 1137 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  23.47 
 
 		 945 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  20.67 
 
 		 696 aa  52.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  22.97 
 
 		 732 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  25.06 
 
 		 499 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  31.21 
 
 		 443 aa  51.2  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  22.9 
 
 		 1131 aa  50.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  24.3 
 
 		 791 aa  50.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  26.32 
 
 		 492 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  24.36 
 
 		 590 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  24.8 
 
 		 609 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  22.47 
 
 		 907 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  25.28 
 
 		 707 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3974  type III restriction enzyme, res subunit  23.22 
 
 		 1093 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.361688  normal  0.0160055 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  30.97 
 
 		 440 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  23.59 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  23.34 
 
 		 509 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  29.31 
 
 		 647 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  24.09 
 
 		 1113 aa  48.5  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  24.2 
 
 		 1126 aa  48.9  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  26.11 
 
 		 494 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  23.56 
 
 		 706 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.66 
 
 		 550 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>