129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0145 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  71.25 
 
 		 595 aa  791    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  78.6 
 
 		 560 aa  881    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  61.52 
 
 		 582 aa  656    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  60.22 
 
 		 591 aa  653    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  78.6 
 
 		 560 aa  881    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  91.99 
 
 		 566 aa  1073    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  78.6 
 
 		 560 aa  881    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.78 
 
 		 593 aa  647    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 		 574 aa  1163    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  62.01 
 
 		 577 aa  667    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  59.23 
 
 		 565 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  76.25 
 
 		 626 aa  867    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  60.18 
 
 		 601 aa  642    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  59.57 
 
 		 574 aa  635    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.42 
 
 		 589 aa  639    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  59.97 
 
 		 622 aa  644    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  61.81 
 
 		 575 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  68.69 
 
 		 563 aa  756    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  61.96 
 
 		 586 aa  644    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  59.72 
 
 		 593 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  59.64 
 
 		 593 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  60.8 
 
 		 618 aa  658    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.43 
 
 		 606 aa  644    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  67.02 
 
 		 572 aa  740    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  59.57 
 
 		 606 aa  638    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  67.67 
 
 		 592 aa  747    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  59.93 
 
 		 628 aa  634  1e-180  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  59.4 
 
 		 598 aa  634  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  58.33 
 
 		 621 aa  633  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  57.32 
 
 		 599 aa  634  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  58.48 
 
 		 569 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  57.81 
 
 		 601 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  47.33 
 
 		 598 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  47.91 
 
 		 594 aa  457  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  46.86 
 
 		 583 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  40.07 
 
 		 559 aa  331  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  30.66 
 
 		 477 aa  182  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  29.08 
 
 		 469 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  30.13 
 
 		 472 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  30.13 
 
 		 472 aa  159  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  28.72 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  30.56 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  29.59 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  29.59 
 
 		 471 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  32.07 
 
 		 466 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  28.88 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  28.69 
 
 		 465 aa  143  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  28.95 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  27.82 
 
 		 434 aa  137  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  26.93 
 
 		 466 aa  136  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  29.85 
 
 		 465 aa  135  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  29.26 
 
 		 458 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  30.52 
 
 		 435 aa  133  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  30.73 
 
 		 456 aa  131  4.0000000000000003e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  27.67 
 
 		 470 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  29.55 
 
 		 429 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  28.45 
 
 		 438 aa  102  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  28.92 
 
 		 622 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  27.32 
 
 		 608 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  25.06 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  23.77 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  24.18 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  32.26 
 
 		 601 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  23.77 
 
 		 489 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  22.69 
 
 		 493 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  23.46 
 
 		 698 aa  72  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.17 
 
 		 385 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  23.59 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  23.51 
 
 		 696 aa  65.1  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  23.86 
 
 		 499 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  22.61 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  25.12 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  26.39 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.8 
 
 		 951 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  27.16 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.96 
 
 		 444 aa  57  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  18.9 
 
 		 732 aa  57  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  25.58 
 
 		 494 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  24.1 
 
 		 590 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  27.18 
 
 		 468 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  22.94 
 
 		 932 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  23.1 
 
 		 932 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  25.53 
 
 		 652 aa  52.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  24.1 
 
 		 995 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  25.76 
 
 		 444 aa  51.6  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0785  EcoEI R domain-containing protein  24.69 
 
 		 791 aa  51.2  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519017  normal  0.352411 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  22.88 
 
 		 464 aa  50.4  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  23.36 
 
 		 509 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  24.63 
 
 		 470 aa  50.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  23.36 
 
 		 509 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  25.28 
 
 		 517 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  24.66 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  29.94 
 
 		 451 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  23.4 
 
 		 945 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  28.33 
 
 		 706 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  22.07 
 
 		 551 aa  48.5  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  28.16 
 
 		 649 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  28.32 
 
 		 666 aa  48.5  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  23.86 
 
 		 479 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1985  type III restriction enzyme, res subunit  26.4 
 
 		 1116 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>