109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0593 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  99.82 
 
 
560 aa  1127    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  99.82 
 
 
560 aa  1127    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  80.43 
 
 
566 aa  909    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  100 
 
 
560 aa  1129    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  78.6 
 
 
574 aa  881    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  62.3 
 
 
577 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  60.97 
 
 
601 aa  648    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  74.29 
 
 
626 aa  830    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  61.4 
 
 
622 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  61.99 
 
 
575 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  60.18 
 
 
565 aa  647    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  68.27 
 
 
563 aa  760    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  60.51 
 
 
618 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  67.08 
 
 
572 aa  744    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  57.57 
 
 
599 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  69.03 
 
 
592 aa  782    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  71.91 
 
 
595 aa  805    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  59.42 
 
 
582 aa  642    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  58.09 
 
 
591 aa  628  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  57.98 
 
 
593 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  57.53 
 
 
593 aa  623  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  58.32 
 
 
593 aa  622  1e-177  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  59.53 
 
 
586 aa  619  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  56.71 
 
 
589 aa  619  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  59.18 
 
 
628 aa  617  1e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  57.04 
 
 
574 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.17 
 
 
606 aa  613  9.999999999999999e-175  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  57.42 
 
 
606 aa  607  9.999999999999999e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  58.46 
 
 
601 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  55.2 
 
 
598 aa  597  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  56.6 
 
 
621 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  57.55 
 
 
569 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  47.82 
 
 
594 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  46.58 
 
 
598 aa  456  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  45.42 
 
 
583 aa  440  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  41.53 
 
 
559 aa  350  4e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  32.48 
 
 
477 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  30.2 
 
 
469 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  31.33 
 
 
464 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  30.38 
 
 
471 aa  156  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  30.2 
 
 
471 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  30.28 
 
 
472 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  30.28 
 
 
472 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  30.2 
 
 
471 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  29.7 
 
 
469 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  30.65 
 
 
465 aa  152  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  29.92 
 
 
465 aa  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  27.48 
 
 
466 aa  146  8.000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  31.53 
 
 
466 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  27.03 
 
 
434 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  29.52 
 
 
458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  29.47 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  30.47 
 
 
435 aa  129  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  25.98 
 
 
470 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  29.9 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  30.82 
 
 
429 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  29.74 
 
 
608 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  28.91 
 
 
438 aa  97.8  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  34.39 
 
 
601 aa  90.5  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  28.47 
 
 
622 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  24.44 
 
 
469 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  23.34 
 
 
489 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  23.34 
 
 
489 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  24.33 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  28.01 
 
 
385 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  24.32 
 
 
493 aa  72  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  23.15 
 
 
698 aa  66.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  23.14 
 
 
932 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  23.65 
 
 
932 aa  61.6  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  24.13 
 
 
706 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  23.96 
 
 
945 aa  58.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  23 
 
 
464 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  23.66 
 
 
1131 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  24.15 
 
 
558 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  25.91 
 
 
440 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  20.38 
 
 
732 aa  53.9  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  23.08 
 
 
936 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  26.55 
 
 
609 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  24.8 
 
 
951 aa  53.5  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  24.74 
 
 
899 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  22.4 
 
 
936 aa  51.6  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  24.8 
 
 
706 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  24.6 
 
 
462 aa  50.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  27.44 
 
 
1144 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  27.44 
 
 
835 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  21 
 
 
696 aa  50.1  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2984  type III restriction protein res subunit  25.14 
 
 
1113 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.135376  normal  0.189592 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  23.71 
 
 
1137 aa  49.3  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.39 
 
 
444 aa  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  21.82 
 
 
933 aa  48.1  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30 
 
 
1129 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  22.97 
 
 
1137 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.52 
 
 
1138 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  26.67 
 
 
949 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  30.91 
 
 
443 aa  46.6  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  22.47 
 
 
1137 aa  46.6  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  22.47 
 
 
1137 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  23.82 
 
 
494 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 
1126 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5222  type III restriction protein res subunit  24.7 
 
 
995 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.276942  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>