170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0376 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  60.68 
 
 		 621 aa  665    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  69.08 
 
 		 593 aa  776    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  79.17 
 
 		 569 aa  905    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.18 
 
 		 592 aa  658    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  61.06 
 
 		 606 aa  670    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  72.29 
 
 		 582 aa  816    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  62.15 
 
 		 593 aa  680    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  62.68 
 
 		 618 aa  675    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  61.88 
 
 		 591 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 574 aa  1162    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  61.66 
 
 		 598 aa  663    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  59.5 
 
 		 566 aa  636    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  59.57 
 
 		 574 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  58.13 
 
 		 563 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  62.12 
 
 		 593 aa  692    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  58.61 
 
 		 595 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  60.64 
 
 		 606 aa  674    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  69.33 
 
 		 586 aa  763    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  63.18 
 
 		 599 aa  712    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  62.15 
 
 		 628 aa  655    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  61.87 
 
 		 622 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  62.72 
 
 		 601 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  60.45 
 
 		 601 aa  633  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  59.65 
 
 		 572 aa  632  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  58 
 
 		 589 aa  634  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  56.45 
 
 		 626 aa  616  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  57.04 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  57.04 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  57.04 
 
 		 560 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  57.09 
 
 		 565 aa  608  9.999999999999999e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  55.63 
 
 		 577 aa  585  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  56.08 
 
 		 575 aa  579  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  49.74 
 
 		 594 aa  485  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  48.12 
 
 		 598 aa  472  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  45.3 
 
 		 583 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  39.65 
 
 		 559 aa  336  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  32.47 
 
 		 477 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  30.08 
 
 		 469 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  32.06 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  32.06 
 
 		 472 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  30.21 
 
 		 465 aa  166  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  30.9 
 
 		 469 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  27.99 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  29.22 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  30.9 
 
 		 464 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  28.44 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  28.44 
 
 		 471 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  30.9 
 
 		 465 aa  151  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  28.07 
 
 		 471 aa  150  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  31.49 
 
 		 466 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  27.96 
 
 		 434 aa  143  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  27.01 
 
 		 458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  27.81 
 
 		 470 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  29.73 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  29.2 
 
 		 435 aa  123  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  26.73 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  29.47 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3690  type III restriction protein res subunit  29.27 
 
 		 622 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  28.51 
 
 		 601 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2879  type III restriction protein res subunit  28.98 
 
 		 608 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450355  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  24.82 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  23.56 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  26.2 
 
 		 706 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  22.33 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  27.13 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  21.06 
 
 		 698 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  28.21 
 
 		 652 aa  65.5  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  27.03 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  25.32 
 
 		 558 aa  63.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  27.53 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  28.28 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  26.02 
 
 		 444 aa  62  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  25.77 
 
 		 654 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2877  type III restriction protein res subunit  23.38 
 
 		 1137 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4712  type III restriction enzyme, res subunit  23.38 
 
 		 1137 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  23 
 
 		 1131 aa  58.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  23.86 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4808  type III restriction enzyme, res subunit  23.38 
 
 		 1137 aa  58.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.564367  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  25.32 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6393  type III restriction protein res subunit  26.29 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  22.01 
 
 		 707 aa  57.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1171  type III restriction enzyme, res subunit  22.85 
 
 		 912 aa  57.4  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.145829  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  26.56 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  28.73 
 
 		 647 aa  57  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  22.52 
 
 		 732 aa  57  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  26.8 
 
 		 451 aa  56.6  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  24.23 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  21.01 
 
 		 696 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  25.2 
 
 		 586 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  24.07 
 
 		 715 aa  55.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3202  type III restriction protein res subunit  23.2 
 
 		 1133 aa  53.9  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1034  type III restriction protein res subunit  24.03 
 
 		 1126 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0485696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  24.33 
 
 		 440 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  24.93 
 
 		 586 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 586 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  25.5 
 
 		 488 aa  52.8  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  24.93 
 
 		 586 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0725  type III restriction protein res subunit  22.58 
 
 		 1005 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.147192 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>