177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3459 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  67.37 
 
 		 469 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  68.43 
 
 		 469 aa  657    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  67.65 
 
 		 471 aa  658    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 472 aa  984    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 472 aa  984    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  67.65 
 
 		 471 aa  658    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  65.75 
 
 		 471 aa  627  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  54.78 
 
 		 465 aa  529  1e-149  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  54.01 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  52.34 
 
 		 466 aa  518  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  51.15 
 
 		 470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  48.18 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  45.53 
 
 		 477 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  51.91 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  43.19 
 
 		 464 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  50.86 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  49.46 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  41.2 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1477  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 599 aa  179  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0376  type III restriction protein res subunit  32.06 
 
 		 574 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2381  ATPase  33.8 
 
 		 569 aa  168  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.191246  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2242  type III restriction protein res subunit  31.39 
 
 		 595 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1291  type III restriction enzyme, res subunit  32.15 
 
 		 598 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25110  DNA/RNA helicase, superfamily II  30.92 
 
 		 593 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.862041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10520  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.17 
 
 		 589 aa  163  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.531597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5135  type III restriction protein res subunit  31.57 
 
 		 622 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0782203 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2588  type III restriction enzyme, res subunit  30.63 
 
 		 591 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245843  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  31.91 
 
 		 563 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1318  type III restriction protein res subunit  30.03 
 
 		 601 aa  161  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0818356  hitchhiker  0.00409906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3879  type III restriction protein res subunit  31.14 
 
 		 593 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0931  type III restriction protein res subunit  31.71 
 
 		 586 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.355478  normal  0.978518 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1719  DNA or RNA helicase of superfamily II-like protein  30.63 
 
 		 582 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193156  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0145  type III restriction enzyme, res subunit  30.13 
 
 		 574 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0759  type III restriction enzyme, res subunit  29.69 
 
 		 566 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.523445  normal  0.362489 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1051  type III restriction protein res subunit  31.42 
 
 		 628 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08280  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.65 
 
 		 606 aa  157  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.265179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0881  type III restriction protein res subunit  31.91 
 
 		 621 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  31.74 
 
 		 559 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  30.28 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  30.28 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  30.28 
 
 		 560 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2320  type III restriction protein res subunit  29.31 
 
 		 593 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000427068 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20110  DNA/RNA helicase, superfamily II  29.1 
 
 		 606 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.24796  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12931  hypothetical protein  28.86 
 
 		 626 aa  149  8e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.129963  normal  0.499246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2743  type III restriction protein res subunit  29.25 
 
 		 618 aa  147  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1502  type III restriction protein res subunit  29.31 
 
 		 572 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1473  type III restriction enzyme, res subunit  30.42 
 
 		 577 aa  143  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4538  type III restriction protein res subunit  30.87 
 
 		 565 aa  143  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.179492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24400  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.79 
 
 		 592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1438  type III restriction protein res subunit  30.08 
 
 		 575 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1380  type III restriction enzyme, res subunit  29.78 
 
 		 601 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.942893  normal  0.0185831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3774  type III restriction protein res subunit  28.17 
 
 		 583 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.476443  normal  0.253817 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3772  type III restriction protein res subunit  27.92 
 
 		 594 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1979  hypothetical protein  27.48 
 
 		 435 aa  110  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0799081 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  43.75 
 
 		 139 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  43.75 
 
 		 139 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0796  type III restriction protein res subunit  27.3 
 
 		 598 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.42368  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0682  hypothetical protein  26.4 
 
 		 456 aa  98.2  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.835313  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08571  helicase domain-containing protein  26.97 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1862  type III restriction enzyme, res subunit  24.16 
 
 		 580 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.547726  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 580 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1751  type III restriction protein res subunit  23.04 
 
 		 584 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1790  type III restriction protein res subunit  23.3 
 
 		 584 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.766528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2533  type III restriction protein res subunit  23.04 
 
 		 584 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.10242  hitchhiker  0.000564265 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1747  type III restriction protein res subunit  23.3 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0541375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2350  type III restriction enzyme, res subunit  22.77 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  23.56 
 
 		 580 aa  67  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  23.54 
 
 		 583 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  22.16 
 
 		 588 aa  65.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  21.93 
 
 		 616 aa  63.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  23.22 
 
 		 579 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  23.2 
 
 		 590 aa  62  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2178  Type III restriction enzyme, res subunit  25.07 
 
 		 873 aa  62.4  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  24.19 
 
 		 558 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  23.4 
 
 		 586 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  23.67 
 
 		 585 aa  61.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  26.49 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  22.93 
 
 		 590 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  23.37 
 
 		 586 aa  60.1  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  22.67 
 
 		 590 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  24.06 
 
 		 597 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  21.87 
 
 		 590 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  24.74 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  23.68 
 
 		 591 aa  58.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  23.06 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  23.19 
 
 		 967 aa  58.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  22.02 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  22.02 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  22.02 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  22.19 
 
 		 586 aa  57  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  22.99 
 
 		 586 aa  56.2  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  22.02 
 
 		 586 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  22.77 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  21.86 
 
 		 585 aa  55.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  25 
 
 		 470 aa  54.7  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03609  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit and related helicase  22.86 
 
 		 1141 aa  55.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0509  type III restriction enzyme, res subunit  27.86 
 
 		 918 aa  53.9  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  22.8 
 
 		 1077 aa  53.9  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1094  type III restriction enzyme, res subunit  22.61 
 
 		 945 aa  53.9  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5514  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  21.81 
 
 		 586 aa  53.1  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>