21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1868 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  290  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  99.28 
 
 		 139 aa  287  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  63.64 
 
 		 470 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  42.86 
 
 		 466 aa  114  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  43.75 
 
 		 472 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  43.75 
 
 		 472 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  36.88 
 
 		 469 aa  102  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  39.46 
 
 		 469 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  40.14 
 
 		 465 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  39.44 
 
 		 465 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  40 
 
 		 471 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  40 
 
 		 471 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  37.06 
 
 		 471 aa  99.4  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  41.43 
 
 		 429 aa  97.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  67.21 
 
 		 458 aa  92  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  59.7 
 
 		 466 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  36.84 
 
 		 477 aa  90.1  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  60.61 
 
 		 465 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  32.61 
 
 		 464 aa  84.7  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  46.58 
 
 		 434 aa  79  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4526  DEAD-like helicase  26.44 
 
 		 559 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>