20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3384 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3384  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  289  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1868  hypothetical protein  99.28 
 
 		 139 aa  287  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.776543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4198  helicase domain protein  63.64 
 
 		 470 aa  176  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0962  putative type III restriction enzyme  42.86 
 
 		 466 aa  114  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  43.75 
 
 		 472 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  43.75 
 
 		 472 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4016  type III restriction protein res subunit  36.88 
 
 		 469 aa  103  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2555  hypothetical protein  39.58 
 
 		 465 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.813616 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0145  type III restriction enzyme, res subunit  38.89 
 
 		 465 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3418  type III restriction enzyme, res subunit  38.78 
 
 		 469 aa  100  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.280626  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4273  type III restriction protein res subunit  39.31 
 
 		 471 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4412  type III restriction protein res subunit  39.31 
 
 		 471 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3839  type III restriction enzyme, res subunit  37.06 
 
 		 471 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0197  helicase domain-containing protein  41.43 
 
 		 429 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.13298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0080  helicase domain-containing protein  59.7 
 
 		 466 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3891  helicase domain-containing protein  67.21 
 
 		 458 aa  92  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1925  GGDEF family protein  36.84 
 
 		 477 aa  91.3  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2283  type III restriction enzyme, res subunit  60.61 
 
 		 465 aa  87  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06217  hypothetical protein  32.61 
 
 		 464 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  45.21 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>