195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2313 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 706 aa  1464    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  33.19 
 
 		 706 aa  299  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  31.13 
 
 		 707 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  31.06 
 
 		 732 aa  275  3e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  29.25 
 
 		 698 aa  263  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0497  type III restriction protein res subunit  29.22 
 
 		 696 aa  261  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.154157  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2087  type III restriction enzyme, res subunit  31.19 
 
 		 715 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.167702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  35.45 
 
 		 493 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3178  type III restriction protein res subunit  42.17 
 
 		 249 aa  200  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  28.53 
 
 		 744 aa  199  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  34.3 
 
 		 492 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  33.85 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  33.63 
 
 		 489 aa  190  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  33.86 
 
 		 489 aa  189  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  27.51 
 
 		 453 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  28.47 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  26.85 
 
 		 385 aa  114  6e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  28.72 
 
 		 650 aa  102  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  28.37 
 
 		 654 aa  100  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4564  helicase-like  25.88 
 
 		 453 aa  99.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  30.4 
 
 		 1065 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  30.4 
 
 		 1065 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  27.56 
 
 		 494 aa  94  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  25.28 
 
 		 509 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  25.28 
 
 		 509 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  26.05 
 
 		 449 aa  93.6  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  25.13 
 
 		 951 aa  92.4  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  27.98 
 
 		 647 aa  92.4  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  27.49 
 
 		 652 aa  92.4  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  27.04 
 
 		 444 aa  89.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  26.93 
 
 		 466 aa  88.6  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  26.99 
 
 		 451 aa  88.6  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0451  DNA repair helicase  29.49 
 
 		 218 aa  88.6  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000151647 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  27.41 
 
 		 470 aa  86.7  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  25.76 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  24.65 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  26.75 
 
 		 531 aa  80.1  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  22.94 
 
 		 551 aa  79.7  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  24.88 
 
 		 466 aa  79.7  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  27.13 
 
 		 928 aa  78.6  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  23.94 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  25.96 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  25 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  25.83 
 
 		 889 aa  75.5  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  24.74 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  24.94 
 
 		 848 aa  75.9  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  25.37 
 
 		 590 aa  75.1  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  25.94 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.84 
 
 		 633 aa  74.7  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  26.43 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  25.75 
 
 		 444 aa  72.8  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  24.32 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  25.3 
 
 		 922 aa  72.4  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  26.71 
 
 		 924 aa  72.4  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  23.42 
 
 		 952 aa  70.9  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  27.46 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3022  type III restriction protein res subunit  21.09 
 
 		 1597 aa  68.9  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  22.92 
 
 		 1108 aa  68.2  0.0000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  24.18 
 
 		 1847 aa  66.6  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  24.04 
 
 		 1348 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  27.75 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  26.13 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0358  type III restriction protein res subunit  22.9 
 
 		 843 aa  65.1  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.421793  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  26.45 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  22.42 
 
 		 1113 aa  63.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0035  superfamily II DNA/RNA helicase  21.25 
 
 		 949 aa  62.4  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0259774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  23.48 
 
 		 977 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  24.75 
 
 		 1613 aa  62  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  22.71 
 
 		 1063 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  24.1 
 
 		 1632 aa  60.8  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  21.19 
 
 		 949 aa  60.5  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  21.73 
 
 		 1418 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  25.1 
 
 		 886 aa  58.9  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  23.02 
 
 		 967 aa  58.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  25.09 
 
 		 797 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  24.84 
 
 		 915 aa  57  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  23.36 
 
 		 443 aa  56.6  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  24.45 
 
 		 1129 aa  55.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11440  DNA/RNA helicase, superfamily II  22.87 
 
 		 974 aa  55.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000321567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.38 
 
 		 681 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  23.21 
 
 		 572 aa  55.1  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2515  type III restriction enzyme, res subunit  20.72 
 
 		 953 aa  54.3  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2567  type III restriction protein res subunit  20.72 
 
 		 953 aa  54.3  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  21.52 
 
 		 1131 aa  53.9  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  23.21 
 
 		 1636 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  24.78 
 
 		 910 aa  53.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  33.33 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  25.6 
 
 		 1116 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  23.65 
 
 		 558 aa  52.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0549  DEAD/H associated domain protein  24.33 
 
 		 943 aa  52.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0909316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  20.03 
 
 		 813 aa  52  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  23.02 
 
 		 491 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0593  type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 560 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.147168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0602  type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 560 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.44982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0615  type III restriction enzyme, res subunit  24.8 
 
 		 560 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0443  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.25 
 
 		 685 aa  50.8  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0388  type III restriction protein res subunit  22.4 
 
 		 907 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000267171 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  26.63 
 
 		 649 aa  50.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  22.1 
 
 		 1004 aa  49.7  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>