179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2946 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2946  hypothetical protein  100 
 
 		 730 aa  1485    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.505303  hitchhiker  0.00920589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1537  helicase domain-containing protein  25.37 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.453838  normal  0.138046 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  23.42 
 
 		 550 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0307  Type III restriction enzyme, res subunit  22.6 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0435132  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0759  type III restriction protein res subunit  25.7 
 
 		 812 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.535387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2354  type III restriction protein res subunit  23.55 
 
 		 586 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0370  type III restriction protein res subunit  27.3 
 
 		 1055 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0484136  hitchhiker  0.000113274 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0362  type III restriction enzyme, res subunit  27.3 
 
 		 1055 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2780  type III restriction enzyme, res subunit  24.79 
 
 		 586 aa  67.4  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0188494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0360  type III restriction protein res subunit  27.3 
 
 		 1055 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl314  DNA repair DNA/RNA helicase  22.22 
 
 		 905 aa  65.1  0.000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.84028e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1309  EcoEI R domain-containing protein  23.16 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1080  type III restriction protein res subunit  24.21 
 
 		 607 aa  64.7  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000886806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1908  type III restriction protein res subunit  22.19 
 
 		 586 aa  64.3  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4503  type III restriction enzyme, res subunit  24.06 
 
 		 1052 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000814753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0368  helicase  25.41 
 
 		 982 aa  64.3  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1467  type III restriction enzyme, res subunit  22.15 
 
 		 583 aa  63.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387336  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2523  type III restriction enzyme, res subunit  24.94 
 
 		 967 aa  63.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0698946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2034  type III restriction protein res subunit  23.23 
 
 		 813 aa  63.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  22.38 
 
 		 583 aa  63.9  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2440  type III restriction protein res subunit  22.43 
 
 		 591 aa  63.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0480  type III restriction protein res subunit  23.95 
 
 		 606 aa  63.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000916808  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  21.81 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0337  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.15 
 
 		 979 aa  62  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3048  helicase domain protein  22.3 
 
 		 545 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0891205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2695  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.16 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.089972  hitchhiker  0.000356695 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2537  type III restriction protein res subunit  22.06 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02470  DEAD box family helicase, putative  35.9 
 
 		 706 aa  60.5  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.384709  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3374  putative helicase  23.25 
 
 		 1017 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.175998  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2089  type III restriction enzyme, res subunit  22.04 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.553683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0594  type III restriction protein res subunit  22.2 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11338  hypothetical protein  24.11 
 
 		 503 aa  59.7  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2280  type III restriction enzyme, res subunit  22.69 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3535  hypothetical protein  24.66 
 
 		 815 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.115476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  23.91 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  22.87 
 
 		 899 aa  58.9  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2939  helicase domain protein  22.22 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  22.28 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  24.49 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  24.49 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  24.49 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  22.83 
 
 		 1418 aa  58.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  24.49 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3253  type III restriction protein res subunit  21.18 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.503255  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0301  type III restriction enzyme, res subunit  23.21 
 
 		 1051 aa  57.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.177385  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  23.58 
 
 		 581 aa  57.8  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2618  EcoEI R domain-containing protein  23.37 
 
 		 817 aa  57.8  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0707543 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  23.44 
 
 		 586 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  23.64 
 
 		 1287 aa  57.4  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  23.44 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  25.16 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1193  EcoEI R domain protein  23.37 
 
 		 827 aa  57  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325861  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3842  type III restriction enzyme, res subunit  22.44 
 
 		 1061 aa  57.4  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2941  type III restriction protein res subunit  23.66 
 
 		 815 aa  57.4  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  23.62 
 
 		 586 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  24.11 
 
 		 586 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2080  helicase  35.87 
 
 		 588 aa  57.4  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.453275  normal  0.977675 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3192  type III restriction enzyme, res subunit  23.1 
 
 		 928 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3225  EcoEI R domain-containing protein  24.22 
 
 		 815 aa  57  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.376811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1258  type III restriction protein res subunit  24.3 
 
 		 787 aa  57.4  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.377183  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  23.62 
 
 		 586 aa  57  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2082  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  24.57 
 
 		 574 aa  57  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1489  putative helicase  23.08 
 
 		 585 aa  57.4  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.931099  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06707  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05530)  26.78 
 
 		 643 aa  56.6  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0069  Type III restriction enzyme, res subunit  38.1 
 
 		 629 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  24.6 
 
 		 797 aa  56.2  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3456  type III restriction enzyme, res subunit  23.11 
 
 		 597 aa  56.6  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2990  EcoEI R domain protein  23.74 
 
 		 875 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  23.62 
 
 		 586 aa  56.6  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1532  type III restriction enzyme, res subunit  22.03 
 
 		 579 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.413566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3530  transposase, IS4 family protein  22.85 
 
 		 956 aa  55.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.793252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2719  putative helicase  23.08 
 
 		 585 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00330465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2559  type III restriction protein res subunit  22.29 
 
 		 580 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2794  type III restriction protein res subunit  23.08 
 
 		 585 aa  56.6  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183482  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  24.83 
 
 		 1113 aa  55.8  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1543  type III restriction protein res subunit  23.51 
 
 		 979 aa  55.8  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  23.62 
 
 		 586 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1089  type III restriction protein res subunit  24.37 
 
 		 1051 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4932  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  34.34 
 
 		 1169 aa  55.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1412  type III restriction protein res subunit  23.58 
 
 		 556 aa  55.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00105152  normal  0.0540272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  24.15 
 
 		 1636 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  24.77 
 
 		 776 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4439  type III restriction protein res subunit  32.31 
 
 		 510 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226232  normal  0.536892 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1295  type III restriction enzyme, res subunit  31.91 
 
 		 584 aa  54.3  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1637  type III restriction protein res subunit  32.32 
 
 		 586 aa  54.3  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  22.65 
 
 		 783 aa  54.3  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  23.84 
 
 		 1077 aa  54.3  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2363  type III restriction enzyme, res subunit  20.33 
 
 		 590 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0989425  normal  0.0932294 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1637  Type I site-specific deoxyribonuclease  25.19 
 
 		 804 aa  53.5  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.000133951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1350  type III restriction protein res subunit  42.5 
 
 		 967 aa  53.9  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.810752  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1408  helicase, putative  23.66 
 
 		 987 aa  53.1  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2744  helicase  20.88 
 
 		 590 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0226  type III restriction protein res subunit  24.11 
 
 		 760 aa  53.5  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1242  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  22.38 
 
 		 657 aa  53.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000376746  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  23.02 
 
 		 499 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2435  type III restriction enzyme, res subunit  19.43 
 
 		 590 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8690  putative helicase  24.07 
 
 		 469 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2524  type III restriction enzyme, res subunit  20.44 
 
 		 590 aa  52  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.251269  normal  0.0163499 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1575  type I restriction-modification system, R subunit  23.88 
 
 		 760 aa  52  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0931  type III restriction protein res subunit  32.11 
 
 		 601 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>