18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0760 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1466  hypothetical protein  55.49 
 
 		 683 aa  721    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0760  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 		 646 aa  1326    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.254087  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0029  helicase-like  51.37 
 
 		 693 aa  669    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3042  DEAD-like helicase  55.27 
 
 		 669 aa  751    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1963  Pseudomurein-binding repeat protein  46.24 
 
 		 683 aa  595  1e-169  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0186142  normal  0.027049 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4500  DEAD/DEAH box helicase-like  46.32 
 
 		 692 aa  586  1e-166  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.235667  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2529  hypothetical protein  46.15 
 
 		 684 aa  580  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0104824  hitchhiker  0.000333956 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1751  YeeB-like protein  45.06 
 
 		 702 aa  579  1e-164  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3314  hypothetical protein  45.99 
 
 		 691 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15590  hypothetical protein  45.85 
 
 		 705 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000202658  unclonable  2.39416e-21 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5332  Sea12  45.79 
 
 		 687 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0264  hypothetical protein  46.36 
 
 		 689 aa  557  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.942958  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1285  YeeB-like protein  44.81 
 
 		 703 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000202584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7689  hypothetical protein  50.95 
 
 		 597 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1839  type III restriction protein res subunit  23.25 
 
 		 563 aa  47.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.036346  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4219  FOG domain-containing protein  22.49 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.701537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3459  type III restriction protein res subunit  19.05 
 
 		 472 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1893  type III restriction protein res subunit  19.05 
 
 		 472 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>