More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3529 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3529  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 620 aa  1247    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.600599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.41 
 
 		 607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.58 
 
 		 625 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.08 
 
 		 633 aa  567  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.88 
 
 		 625 aa  566  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.42 
 
 		 598 aa  567  1e-160  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.43 
 
 		 611 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.43 
 
 		 611 aa  566  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.58 
 
 		 598 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  48.92 
 
 		 600 aa  562  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.41 
 
 		 601 aa  561  1.0000000000000001e-159  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.59 
 
 		 600 aa  561  1e-158  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.33 
 
 		 619 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.19 
 
 		 626 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.84 
 
 		 719 aa  554  1e-156  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  49.36 
 
 		 637 aa  552  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.08 
 
 		 600 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.5 
 
 		 609 aa  553  1e-156  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.37 
 
 		 615 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 616 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.12 
 
 		 630 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.09 
 
 		 711 aa  545  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.49 
 
 		 599 aa  544  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.8 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.77 
 
 		 625 aa  542  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.31 
 
 		 637 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  49.09 
 
 		 618 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.58 
 
 		 714 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.7 
 
 		 612 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.12 
 
 		 657 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49 
 
 		 611 aa  537  1e-151  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48 
 
 		 633 aa  536  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33130  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.08 
 
 		 607 aa  538  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0486618  normal  0.887985 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.6 
 
 		 618 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.25 
 
 		 601 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30110  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.18 
 
 		 617 aa  535  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.17 
 
 		 715 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0697  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.75 
 
 		 662 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.25 
 
 		 709 aa  529  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.33 
 
 		 715 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  47.25 
 
 		 709 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.57 
 
 		 715 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.5 
 
 		 647 aa  529  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.22 
 
 		 621 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.39 
 
 		 622 aa  529  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.5 
 
 		 617 aa  528  1e-148  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3336  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.75 
 
 		 616 aa  528  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.74 
 
 		 709 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2981  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.84 
 
 		 693 aa  528  1e-148  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.21 
 
 		 618 aa  525  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.24 
 
 		 712 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  48.76 
 
 		 628 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5549  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.75 
 
 		 606 aa  525  1e-147  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.132068  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.83 
 
 		 615 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.83 
 
 		 615 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.83 
 
 		 647 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0731  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.34 
 
 		 625 aa  523  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.49 
 
 		 707 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.83 
 
 		 615 aa  522  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.83 
 
 		 615 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0141  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.62 
 
 		 677 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.91 
 
 		 711 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.83 
 
 		 658 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.1 
 
 		 615 aa  519  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5464  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.49 
 
 		 605 aa  519  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.26 
 
 		 596 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3105  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.94 
 
 		 613 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.34837  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.84 
 
 		 603 aa  520  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.26 
 
 		 710 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.83 
 
 		 763 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0556  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.79 
 
 		 659 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.51 
 
 		 639 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.5 
 
 		 644 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.62 
 
 		 615 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17970  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.48 
 
 		 631 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.510597  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.26 
 
 		 603 aa  512  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  44.08 
 
 		 608 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  43.91 
 
 		 608 aa  514  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.12 
 
 		 615 aa  510  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.94 
 
 		 615 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.32 
 
 		 633 aa  510  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 623 aa  509  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2194  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.35 
 
 		 603 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.44 
 
 		 615 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1851  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.35 
 
 		 603 aa  510  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.484605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.12 
 
 		 615 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.65 
 
 		 748 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2363  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.93 
 
 		 622 aa  505  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.12 
 
 		 615 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.02 
 
 		 705 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.12 
 
 		 615 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.92 
 
 		 599 aa  503  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.95 
 
 		 615 aa  503  1e-141  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.07 
 
 		 605 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0108  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.49 
 
 		 595 aa  501  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179764  normal  0.109981 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.81 
 
 		 739 aa  500  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.32 
 
 		 623 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.95 
 
 		 615 aa  502  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.57 
 
 		 602 aa  499  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.58 
 
 		 616 aa  498  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>