More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4701 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.85 
 
 		 615 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0556  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.6 
 
 		 659 aa  685    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.65 
 
 		 615 aa  730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.55 
 
 		 715 aa  642    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.84 
 
 		 615 aa  729    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2363  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.72 
 
 		 622 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.05 
 
 		 633 aa  669    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.98 
 
 		 612 aa  682    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.27 
 
 		 719 aa  698    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  60.55 
 
 		 637 aa  714    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0697  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.42 
 
 		 662 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.71 
 
 		 715 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  76.05 
 
 		 625 aa  971    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.85 
 
 		 615 aa  745    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.32 
 
 		 715 aa  641    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.98 
 
 		 621 aa  645    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.12 
 
 		 617 aa  679    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.89 
 
 		 615 aa  741    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.38 
 
 		 626 aa  650    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  63.59 
 
 		 598 aa  728    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3336  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.05 
 
 		 616 aa  652    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.85 
 
 		 647 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.85 
 
 		 658 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.63 
 
 		 709 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30110  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.54 
 
 		 617 aa  680    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.36 
 
 		 657 aa  716    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.52 
 
 		 615 aa  731    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  57.6 
 
 		 600 aa  690    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  57.05 
 
 		 628 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3105  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.12 
 
 		 613 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.34837  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.87 
 
 		 739 aa  637    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.48 
 
 		 625 aa  648    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.35 
 
 		 598 aa  710    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.85 
 
 		 644 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.85 
 
 		 615 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  100 
 
 		 618 aa  1256    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.69 
 
 		 615 aa  735    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.79 
 
 		 714 aa  641    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.33 
 
 		 639 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.81 
 
 		 618 aa  706    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.13 
 
 		 611 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.13 
 
 		 611 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.77 
 
 		 633 aa  708    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.03 
 
 		 615 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0141  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.34 
 
 		 677 aa  692    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  90.94 
 
 		 619 aa  1140    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  62.07 
 
 		 630 aa  744    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0731  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.42 
 
 		 625 aa  650    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.35 
 
 		 615 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.17 
 
 		 615 aa  732    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.84 
 
 		 615 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.25 
 
 		 623 aa  681    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.6 
 
 		 600 aa  689    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.85 
 
 		 615 aa  745    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.32 
 
 		 647 aa  643    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.25 
 
 		 623 aa  679    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.7 
 
 		 711 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2981  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.46 
 
 		 693 aa  666    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.49 
 
 		 707 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.09 
 
 		 609 aa  664    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33130  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.71 
 
 		 607 aa  636    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0486618  normal  0.887985 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17970  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.4 
 
 		 631 aa  650    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.510597  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.36 
 
 		 611 aa  692    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.7 
 
 		 601 aa  698    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.58 
 
 		 622 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61 
 
 		 615 aa  729    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.28 
 
 		 712 aa  639    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.9 
 
 		 607 aa  710    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.2 
 
 		 637 aa  712    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.02 
 
 		 710 aa  635    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0108  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.76 
 
 		 595 aa  644    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179764  normal  0.109981 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.84 
 
 		 615 aa  729    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.41 
 
 		 605 aa  642    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5549  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.2 
 
 		 606 aa  651    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.132068  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.85 
 
 		 633 aa  736    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.48 
 
 		 636 aa  718    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.2 
 
 		 711 aa  723    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.85 
 
 		 763 aa  745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  88.91 
 
 		 616 aa  1122    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.18 
 
 		 625 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.09 
 
 		 705 aa  689    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.32 
 
 		 709 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  53.65 
 
 		 709 aa  634  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5464  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.41 
 
 		 605 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.27 
 
 		 603 aa  629  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1851  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.19 
 
 		 603 aa  628  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.484605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2194  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.19 
 
 		 603 aa  628  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.49 
 
 		 618 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2090  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.98 
 
 		 621 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.23 
 
 		 600 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.09 
 
 		 599 aa  617  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.81 
 
 		 748 aa  601  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.22 
 
 		 714 aa  599  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.82 
 
 		 601 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.41 
 
 		 603 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.09 
 
 		 715 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.08 
 
 		 596 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.42 
 
 		 599 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.58 
 
 		 599 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1996  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.06 
 
 		 629 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>