More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0084 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009080  BMA10247_3472  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 615 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6926  ATP-dependent DNA helicase  57.56 
 
 		 628 aa  668    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0650469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 658 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0695  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.51 
 
 		 612 aa  667    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1868  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.98 
 
 		 719 aa  640    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  61.55 
 
 		 637 aa  750    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  80.1 
 
 		 633 aa  1023    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.35 
 
 		 637 aa  752    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2638  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 615 aa  740    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.923469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0697  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.07 
 
 		 662 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0913  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.14 
 
 		 617 aa  657    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.631203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.26 
 
 		 615 aa  737    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5464  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.25 
 
 		 605 aa  645    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0896  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.61 
 
 		 598 aa  709    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0141  ATP-dependent DNA helicase RecQ  77.14 
 
 		 677 aa  1004    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 647 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2363  ATP-dependent DNA helicase RecQ  83.12 
 
 		 622 aa  1015    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  62.26 
 
 		 636 aa  759    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3441  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.97 
 
 		 615 aa  735    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000567848  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3752  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 615 aa  740    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.33 
 
 		 601 aa  677    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.69477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0103  ATP-dependent DNA helicase RecQ  94.7 
 
 		 623 aa  1185    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.91 
 
 		 598 aa  681    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.53 
 
 		 625 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.78 
 
 		 615 aa  742    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.29 
 
 		 644 aa  737    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0876032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5549  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.79 
 
 		 606 aa  640    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.132068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  58.25 
 
 		 618 aa  696    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1047  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59 
 
 		 657 aa  712    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.763377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 763 aa  742    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0459  ATP-dependent DNA helicase RecQ  75.08 
 
 		 618 aa  938    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.08 
 
 		 611 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.08 
 
 		 611 aa  674    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  73.27 
 
 		 633 aa  915    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.97 
 
 		 615 aa  751    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0108  ATP-dependent DNA helicase RecQ  68.89 
 
 		 595 aa  786    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179764  normal  0.109981 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.67 
 
 		 619 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.78 
 
 		 630 aa  729    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.42 
 
 		 615 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0734  ATP-dependent DNA helicase  55.61 
 
 		 600 aa  657    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.792164  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2765  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.78 
 
 		 615 aa  742    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.43 
 
 		 711 aa  667    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0556  ATP-dependent DNA helicase RecQ  63.93 
 
 		 659 aa  796    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5313  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.05 
 
 		 616 aa  713    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3336  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.44 
 
 		 616 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.49 
 
 		 607 aa  664    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.26 
 
 		 615 aa  743    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.62 
 
 		 615 aa  740    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0084  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 623 aa  1274    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0649  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.28 
 
 		 600 aa  654    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.03 
 
 		 611 aa  659    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3105  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.87 
 
 		 613 aa  654    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.34837  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.57 
 
 		 615 aa  742    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.62 
 
 		 615 aa  739    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.313912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30110  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.65 
 
 		 617 aa  670    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.756128 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.78 
 
 		 615 aa  742    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0731  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.37 
 
 		 625 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2981  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.93 
 
 		 693 aa  680    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33130  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.7 
 
 		 607 aa  644    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0486618  normal  0.887985 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.81 
 
 		 615 aa  749    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1438  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.44 
 
 		 625 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  81.54 
 
 		 705 aa  1084    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  72.49 
 
 		 639 aa  907    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.01 
 
 		 633 aa  632  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.34 
 
 		 709 aa  634  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0839  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.73 
 
 		 626 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.305009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20810  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.12 
 
 		 712 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0299  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.37 
 
 		 609 aa  627  1e-178  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236448  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.57 
 
 		 714 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824216  hitchhiker  0.00000305051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1786  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.05 
 
 		 711 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32800  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.6 
 
 		 707 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3738  ATP-dependent DNA helicase RecQ:ATP-requiring DNA helicase RecQ  52.81 
 
 		 709 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145176  normal  0.0175539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1644  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.49 
 
 		 709 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17970  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.34 
 
 		 631 aa  616  1e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.510597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.83 
 
 		 715 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4516  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.08 
 
 		 715 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4022  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.92 
 
 		 715 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.75 
 
 		 625 aa  609  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1812  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.72 
 
 		 710 aa  609  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.646087  normal  0.880119 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1489  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.94 
 
 		 603 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536233  normal  0.0818763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2090  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.63 
 
 		 621 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.375473  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2226  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.39 
 
 		 647 aa  600  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2446  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.77 
 
 		 739 aa  590  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.772322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.5 
 
 		 605 aa  587  1e-166  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.49 
 
 		 618 aa  582  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50 
 
 		 621 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.51 
 
 		 622 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2194  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.54 
 
 		 603 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1851  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.54 
 
 		 603 aa  580  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.484605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.56 
 
 		 603 aa  565  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.51 
 
 		 600 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.24 
 
 		 748 aa  566  1e-160  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.41 
 
 		 601 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.93 
 
 		 599 aa  558  1e-157  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.84 
 
 		 608 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.67 
 
 		 608 aa  552  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.77 
 
 		 614 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 609 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 609 aa  545  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.64 
 
 		 611 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>