More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2724 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2724  helicase domain protein  100 
 
 		 648 aa  1277    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000143899  hitchhiker  0.000226715 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2510  helicase domain protein  76.96 
 
 		 217 aa  321  3e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238792  hitchhiker  0.00294897 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4415  helicase domain protein  34.17 
 
 		 762 aa  316  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.872942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  23.27 
 
 		 574 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 1048 aa  107  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  25.09 
 
 		 906 aa  104  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  24.38 
 
 		 1185 aa  100  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  28.31 
 
 		 726 aa  99.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  24.06 
 
 		 1072 aa  96.3  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  26.1 
 
 		 621 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  23.83 
 
 		 1531 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  25.55 
 
 		 1013 aa  92  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.55 
 
 		 925 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  24.09 
 
 		 924 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  23.41 
 
 		 1047 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.48 
 
 		 1047 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.66 
 
 		 933 aa  88.2  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  25.5 
 
 		 1019 aa  87.8  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  23.65 
 
 		 1078 aa  87.4  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  23.06 
 
 		 918 aa  87  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  24.65 
 
 		 1063 aa  85.9  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  23.22 
 
 		 918 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  22.43 
 
 		 1064 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  21.53 
 
 		 1067 aa  85.5  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  26.54 
 
 		 1025 aa  85.1  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  22.86 
 
 		 918 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  23.49 
 
 		 1065 aa  85.1  0.000000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  21.44 
 
 		 1175 aa  84  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  24.06 
 
 		 638 aa  84  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  24.01 
 
 		 1006 aa  84  0.000000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  25.35 
 
 		 988 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  22.86 
 
 		 918 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  22.86 
 
 		 918 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  22.86 
 
 		 918 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  22.86 
 
 		 918 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  22.86 
 
 		 918 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  26.19 
 
 		 1163 aa  82.4  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  24.24 
 
 		 898 aa  82  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  22.86 
 
 		 918 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  21.46 
 
 		 1064 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  22.65 
 
 		 918 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  22.54 
 
 		 1064 aa  82.4  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  23.39 
 
 		 902 aa  82  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  24.01 
 
 		 914 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  25.51 
 
 		 872 aa  81.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  21.41 
 
 		 1064 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  21.41 
 
 		 1064 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  21.41 
 
 		 1064 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  21.41 
 
 		 1064 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  26.29 
 
 		 990 aa  80.9  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  21.93 
 
 		 1064 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  24.09 
 
 		 1099 aa  79.7  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  22 
 
 		 1064 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  26.02 
 
 		 1033 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.63 
 
 		 1110 aa  79.7  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  20.04 
 
 		 1152 aa  79.7  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  23.8 
 
 		 918 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  23.09 
 
 		 1354 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  24.7 
 
 		 899 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  23.79 
 
 		 1073 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  23.64 
 
 		 1073 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  23.23 
 
 		 1048 aa  78.6  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  22.85 
 
 		 1007 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  22.02 
 
 		 1073 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  23.25 
 
 		 1154 aa  77.4  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.01 
 
 		 1073 aa  77  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  23.05 
 
 		 1073 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  21.37 
 
 		 1068 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  25.52 
 
 		 617 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 		 1002 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 		 1074 aa  75.1  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  25.05 
 
 		 1381 aa  74.7  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.65 
 
 		 895 aa  73.9  0.000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.37 
 
 		 1403 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.57 
 
 		 1160 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  20.94 
 
 		 1112 aa  73.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  21.65 
 
 		 1082 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  27.25 
 
 		 1096 aa  73.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  24.02 
 
 		 892 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  23.76 
 
 		 777 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  23.37 
 
 		 1040 aa  73.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  24.9 
 
 		 1357 aa  72.8  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.58 
 
 		 1028 aa  72  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  23.48 
 
 		 901 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  23.19 
 
 		 1127 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  24.59 
 
 		 896 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0034  DEAD/DEAH box helicase-like  26.47 
 
 		 531 aa  72  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  21.81 
 
 		 1161 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.78 
 
 		 1112 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  21.54 
 
 		 1070 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  36.51 
 
 		 949 aa  71.6  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  20.6 
 
 		 1084 aa  71.6  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.59 
 
 		 907 aa  71.2  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  24.34 
 
 		 709 aa  71.2  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2758  helicase domain protein  25.6 
 
 		 672 aa  70.5  0.00000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  21.4 
 
 		 1082 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  22.75 
 
 		 917 aa  70.1  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  20.53 
 
 		 1066 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  20.65 
 
 		 1084 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  23.4 
 
 		 876 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>