275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2510 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2510  helicase domain protein  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238792  hitchhiker  0.00294897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2724  helicase domain protein  76.96 
 
 		 648 aa  299  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000143899  hitchhiker  0.000226715 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4415  helicase domain protein  37.63 
 
 		 762 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.872942 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 906 aa  76.3  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  33.33 
 
 		 638 aa  72  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 		 1112 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26634  predicted protein  32.48 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 		 1048 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  29.09 
 
 		 1064 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  32.71 
 
 		 918 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  32.71 
 
 		 918 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  25.63 
 
 		 574 aa  65.9  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 		 925 aa  64.7  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  28.18 
 
 		 1064 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  28.79 
 
 		 918 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  36.79 
 
 		 777 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  28.79 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  28.79 
 
 		 918 aa  64.3  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  28.79 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  28.79 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  28.79 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  28.79 
 
 		 918 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  29.81 
 
 		 903 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1005  SNF2-related protein  33.6 
 
 		 949 aa  64.7  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0452691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  27.4 
 
 		 924 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 		 918 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  29.66 
 
 		 1531 aa  63.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  30.71 
 
 		 1034 aa  63.5  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 898 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  29.66 
 
 		 1019 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  35.85 
 
 		 1449 aa  62.8  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 		 1066 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 		 933 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  29.91 
 
 		 918 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  30.36 
 
 		 709 aa  62.4  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 		 1068 aa  62  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.02 
 
 		 1403 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  31.11 
 
 		 958 aa  61.6  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  36.11 
 
 		 1025 aa  61.6  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 901 aa  61.6  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  30.97 
 
 		 1047 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  27.27 
 
 		 1064 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  27.27 
 
 		 1064 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  27.27 
 
 		 1064 aa  61.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  27.27 
 
 		 1064 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  39.08 
 
 		 988 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  27.27 
 
 		 1064 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  30.77 
 
 		 1048 aa  61.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  27.27 
 
 		 1064 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  30.15 
 
 		 899 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46007  predicted protein  30.15 
 
 		 773 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.1 
 
 		 907 aa  60.5  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  27.27 
 
 		 1064 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  30.97 
 
 		 1078 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  30.89 
 
 		 980 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 1047 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  33.7 
 
 		 711 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  25.85 
 
 		 1006 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2550  helicase domain protein  29.12 
 
 		 714 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310185  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  29.2 
 
 		 1072 aa  59.3  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  33.33 
 
 		 1102 aa  58.9  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  28.97 
 
 		 1013 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  30.91 
 
 		 1357 aa  58.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  27.73 
 
 		 1084 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.19 
 
 		 895 aa  58.5  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  33.68 
 
 		 1142 aa  58.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  25.69 
 
 		 621 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  25.66 
 
 		 1007 aa  58.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  29.17 
 
 		 1040 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  31.01 
 
 		 917 aa  58.2  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  28.57 
 
 		 1019 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  31.09 
 
 		 1354 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  29.06 
 
 		 1063 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  32.67 
 
 		 990 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 1152 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  28.45 
 
 		 1125 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  34.48 
 
 		 1386 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  26.05 
 
 		 1077 aa  57  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4057  non-specific serine/threonine protein kinase  30.41 
 
 		 931 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.928236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  28.05 
 
 		 1033 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  29.23 
 
 		 896 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0034  DEAD/DEAH box helicase-like  30.5 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  29.63 
 
 		 1150 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  33.33 
 
 		 1126 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 		 1082 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  32.69 
 
 		 872 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1362 aa  56.6  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1675  helicase domain-containing protein  35.65 
 
 		 723 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0725077  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  29.73 
 
 		 1032 aa  56.2  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  34.34 
 
 		 1096 aa  56.2  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.68 
 
 		 1067 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.42 
 
 		 1099 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4127  SNF2-related protein  29.08 
 
 		 885 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  27.5 
 
 		 918 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  27.5 
 
 		 914 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  31.91 
 
 		 1141 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2758  helicase domain protein  29.34 
 
 		 672 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 		 876 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  24.65 
 
 		 1175 aa  55.1  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  30.84 
 
 		 663 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>