More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_26634 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_26634  predicted protein  100 
 
 		 233 aa  483  1e-135  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  40.84 
 
 		 638 aa  135  8e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  41.38 
 
 		 906 aa  99  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26262  predicted protein  35.63 
 
 		 1148 aa  89  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746999  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2758  helicase domain protein  34.12 
 
 		 672 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  35.29 
 
 		 832 aa  86.7  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  37.14 
 
 		 709 aa  86.3  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21820  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.09 
 
 		 690 aa  85.5  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND06010  conserved hypothetical protein  35.11 
 
 		 1765 aa  85.1  8e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.416576  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2550  helicase domain protein  40.46 
 
 		 714 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310185  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1675  helicase domain-containing protein  41.09 
 
 		 723 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0725077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  33.55 
 
 		 1003 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  33.1 
 
 		 1069 aa  82  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 		 982 aa  81.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  33.1 
 
 		 1069 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119553  Swr1-Pie_related helicase  31.03 
 
 		 1053 aa  80.5  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00241522  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  34.11 
 
 		 707 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17728  predicted protein  37.76 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.304466  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 1261 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  34.38 
 
 		 959 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  34.27 
 
 		 1557 aa  80.9  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  35.86 
 
 		 726 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  36.69 
 
 		 648 aa  79  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  33.33 
 
 		 1062 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  33.55 
 
 		 574 aa  78.2  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  26.17 
 
 		 1558 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  33.06 
 
 		 1130 aa  76.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0810  helicase domain protein  35.66 
 
 		 737 aa  76.6  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  38.95 
 
 		 1904 aa  76.3  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09077  Helicase swr1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5ARK3]  31.82 
 
 		 1698 aa  75.9  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  32.03 
 
 		 1250 aa  75.1  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15881  predicted protein  34.11 
 
 		 1326 aa  75.1  0.0000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 		 848 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12368  predicted protein  31.78 
 
 		 126 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.138069  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  32.41 
 
 		 1093 aa  75.1  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  33.63 
 
 		 1269 aa  75.1  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  30.6 
 
 		 956 aa  74.3  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6693  SNF2-related protein  38.32 
 
 		 1121 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  32.81 
 
 		 1023 aa  73.2  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  30.92 
 
 		 1064 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  31.78 
 
 		 1848 aa  73.6  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 		 1068 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.41 
 
 		 977 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  37.23 
 
 		 1612 aa  73.2  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 		 1068 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  30.53 
 
 		 1084 aa  72.8  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.81 
 
 		 1129 aa  72.8  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  35.16 
 
 		 964 aa  72.4  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  33.59 
 
 		 1362 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  39.25 
 
 		 980 aa  72.8  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 1021 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  30.92 
 
 		 1064 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  28.91 
 
 		 1068 aa  72  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  33.58 
 
 		 1202 aa  71.6  0.000000000009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  32.28 
 
 		 926 aa  71.6  0.000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  30.77 
 
 		 1142 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  37.84 
 
 		 899 aa  71.6  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  30.26 
 
 		 1064 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  30.26 
 
 		 1064 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  30.26 
 
 		 1064 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  30.26 
 
 		 1064 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  30.26 
 
 		 1064 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  32.81 
 
 		 1246 aa  71.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  30.26 
 
 		 1064 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  30.26 
 
 		 1064 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  39.8 
 
 		 658 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  30 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  32.84 
 
 		 1170 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  30 
 
 		 1120 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  32.81 
 
 		 1386 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  36.45 
 
 		 990 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  40.21 
 
 		 650 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  29.69 
 
 		 1087 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17234  predicted protein  30.3 
 
 		 1769 aa  70.9  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.743892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 1066 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 1066 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_11009  predicted protein  36.15 
 
 		 535 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  37 
 
 		 1901 aa  70.9  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  29.29 
 
 		 1194 aa  70.1  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  33.08 
 
 		 872 aa  70.1  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  30.92 
 
 		 842 aa  70.1  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  36.56 
 
 		 1086 aa  70.1  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  36.56 
 
 		 806 aa  70.1  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  30.43 
 
 		 1077 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  33.12 
 
 		 1437 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 		 1082 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  36.61 
 
 		 892 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  32.67 
 
 		 868 aa  68.9  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 1164 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 966 aa  69.3  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  30.67 
 
 		 1127 aa  68.9  0.00000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  27.97 
 
 		 1071 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.79 
 
 		 1048 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  38.78 
 
 		 657 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  31.51 
 
 		 1222 aa  68.9  0.00000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 950 aa  68.9  0.00000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  32.03 
 
 		 1112 aa  68.6  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  28.15 
 
 		 1067 aa  68.6  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  37.89 
 
 		 1013 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  31.34 
 
 		 1193 aa  68.6  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>