More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0810  helicase domain protein  74.82 
 
 		 737 aa  976    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2550  helicase domain protein  68.82 
 
 		 714 aa  876    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21820  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  100 
 
 		 690 aa  1365    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1675  helicase domain-containing protein  69.65 
 
 		 723 aa  874    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0725077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2758  helicase domain protein  66.17 
 
 		 672 aa  823    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  34.35 
 
 		 726 aa  189  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  32.5 
 
 		 1025 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  25.57 
 
 		 1194 aa  149  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  29.62 
 
 		 674 aa  149  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 1155 aa  144  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 1112 aa  143  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  29.4 
 
 		 621 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  28.14 
 
 		 1082 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  28.76 
 
 		 1021 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  28.14 
 
 		 1082 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 		 1108 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  28.51 
 
 		 1150 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  27.92 
 
 		 1082 aa  140  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  25.41 
 
 		 1152 aa  139  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  29.18 
 
 		 1130 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  27.17 
 
 		 906 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  31.85 
 
 		 1126 aa  138  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  25.43 
 
 		 1134 aa  137  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  27.62 
 
 		 1078 aa  137  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  30.16 
 
 		 985 aa  136  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  27.27 
 
 		 1070 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.3 
 
 		 988 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  26.02 
 
 		 1181 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 		 848 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.35 
 
 		 1091 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.59 
 
 		 950 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  28.17 
 
 		 1386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  26.46 
 
 		 1073 aa  135  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 		 1073 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  28.17 
 
 		 1362 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  29.26 
 
 		 1112 aa  135  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.96 
 
 		 1091 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  27.11 
 
 		 1068 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.6 
 
 		 1104 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  25.16 
 
 		 1073 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 		 1073 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  25.79 
 
 		 1069 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  26 
 
 		 1069 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.74 
 
 		 1073 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  27.04 
 
 		 917 aa  132  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.38 
 
 		 1082 aa  131  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  26.15 
 
 		 1437 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 		 1055 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  28.36 
 
 		 1040 aa  131  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  27.71 
 
 		 901 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  26.33 
 
 		 1113 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  27.51 
 
 		 1070 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.33 
 
 		 1113 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 		 892 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 		 1403 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  29.8 
 
 		 773 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  26.27 
 
 		 648 aa  130  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 898 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.3 
 
 		 1069 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 		 1048 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  27.41 
 
 		 914 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  29.42 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  28.05 
 
 		 1072 aa  128  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  24.85 
 
 		 1202 aa  128  3e-28  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 1105 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 1112 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  26.29 
 
 		 1068 aa  128  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  28.28 
 
 		 1381 aa  128  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.25 
 
 		 1031 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  27.41 
 
 		 918 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  27.71 
 
 		 902 aa  127  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  24.71 
 
 		 970 aa  127  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  27 
 
 		 1062 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  26.95 
 
 		 1142 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  27.33 
 
 		 1354 aa  127  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  28.79 
 
 		 666 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  28.79 
 
 		 1105 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  28.02 
 
 		 872 aa  127  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.65 
 
 		 982 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.4 
 
 		 1118 aa  126  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  27.43 
 
 		 1120 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  28.23 
 
 		 1006 aa  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  25.11 
 
 		 1071 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  27.56 
 
 		 1088 aa  125  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  27.37 
 
 		 896 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  27.92 
 
 		 777 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  27.22 
 
 		 1120 aa  124  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 		 1261 aa  124  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  29.08 
 
 		 1357 aa  124  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 1102 aa  123  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6693  SNF2-related protein  27.85 
 
 		 1121 aa  123  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  25.84 
 
 		 959 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  26.53 
 
 		 1086 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  26.38 
 
 		 1023 aa  123  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  25.1 
 
 		 1407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 		 1089 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  26.19 
 
 		 1077 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  25.14 
 
 		 1185 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.06 
 
 		 1102 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  24.95 
 
 		 1003 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>