More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6693 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6693  SNF2-related protein  100 
 
 		 1121 aa  2209    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  35.08 
 
 		 1202 aa  388  1e-106  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  44.21 
 
 		 1086 aa  360  9e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 		 1112 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.29 
 
 		 1068 aa  352  2e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.04 
 
 		 1069 aa  352  2e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.87 
 
 		 1068 aa  351  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.2 
 
 		 1091 aa  350  8e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.83 
 
 		 1139 aa  347  6e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.25 
 
 		 1082 aa  344  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  38.98 
 
 		 1071 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  40.04 
 
 		 1078 aa  337  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  38.27 
 
 		 1087 aa  335  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  40.55 
 
 		 1088 aa  335  3e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.49 
 
 		 1129 aa  334  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.41 
 
 		 1068 aa  334  5e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  41.27 
 
 		 1209 aa  334  6e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  32.71 
 
 		 1069 aa  333  1e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  32.77 
 
 		 1069 aa  333  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  38.98 
 
 		 1072 aa  332  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  40.51 
 
 		 1021 aa  332  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  38.22 
 
 		 1125 aa  328  2.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  41.1 
 
 		 1112 aa  328  3e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.47 
 
 		 1082 aa  328  3e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.5 
 
 		 1112 aa  328  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  39.25 
 
 		 1127 aa  327  7e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  40.44 
 
 		 1181 aa  327  1e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  40.96 
 
 		 1006 aa  323  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  40.13 
 
 		 1082 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  39.28 
 
 		 617 aa  322  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 		 1048 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.72 
 
 		 1104 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 		 1055 aa  322  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  37.61 
 
 		 1194 aa  322  3.9999999999999996e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  39.83 
 
 		 1073 aa  321  5e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  40.04 
 
 		 1062 aa  320  9e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  38.69 
 
 		 1080 aa  320  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  37.79 
 
 		 1134 aa  318  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  39.92 
 
 		 1082 aa  318  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  39.79 
 
 		 1070 aa  318  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  43.53 
 
 		 621 aa  318  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.96 
 
 		 1110 aa  318  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  39.92 
 
 		 1082 aa  317  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  41.42 
 
 		 1019 aa  317  7e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.55 
 
 		 982 aa  317  9e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  39.83 
 
 		 1073 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  39.83 
 
 		 1073 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.4 
 
 		 1261 aa  317  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  38.83 
 
 		 1091 aa  317  9.999999999999999e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  38.53 
 
 		 1077 aa  316  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  37.85 
 
 		 1130 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  38.97 
 
 		 918 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  41.06 
 
 		 903 aa  315  2.9999999999999996e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  39.83 
 
 		 1073 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  40.7 
 
 		 1019 aa  314  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  42.4 
 
 		 985 aa  314  5.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  39.83 
 
 		 1070 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  36.9 
 
 		 964 aa  314  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.04 
 
 		 1073 aa  314  6.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  41.34 
 
 		 1068 aa  313  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 		 918 aa  312  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  38.97 
 
 		 918 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  38.73 
 
 		 918 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  38.73 
 
 		 918 aa  311  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  38.76 
 
 		 918 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  38.56 
 
 		 918 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  38.76 
 
 		 918 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  37.83 
 
 		 959 aa  310  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  38.76 
 
 		 918 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  38 
 
 		 918 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  38.73 
 
 		 918 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  37.45 
 
 		 1031 aa  309  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.79 
 
 		 1028 aa  308  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.96 
 
 		 1047 aa  308  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  40.96 
 
 		 991 aa  308  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  35.32 
 
 		 1250 aa  308  4.0000000000000004e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  39.96 
 
 		 1047 aa  308  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  37.02 
 
 		 1178 aa  308  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  40.53 
 
 		 1150 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  38.99 
 
 		 1007 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.46 
 
 		 1007 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  36.73 
 
 		 1161 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.96 
 
 		 1155 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  39.59 
 
 		 1185 aa  305  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  37.72 
 
 		 1067 aa  304  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.98 
 
 		 1029 aa  304  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  37.82 
 
 		 1003 aa  302  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  39.37 
 
 		 1088 aa  302  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  40.67 
 
 		 1086 aa  301  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1215  SNF2-related protein  41.24 
 
 		 958 aa  301  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.559784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.67 
 
 		 1113 aa  301  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  39.67 
 
 		 1113 aa  301  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.64 
 
 		 925 aa  300  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  37.53 
 
 		 1531 aa  300  9e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.45 
 
 		 933 aa  300  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.9 
 
 		 1026 aa  300  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  37.45 
 
 		 1154 aa  300  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  38.23 
 
 		 1013 aa  300  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  39.96 
 
 		 1088 aa  299  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  41.01 
 
 		 988 aa  299  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>