More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1675 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0810  helicase domain protein  68.57 
 
 		 737 aa  883    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2758  helicase domain protein  71.32 
 
 		 672 aa  895    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2550  helicase domain protein  72.69 
 
 		 714 aa  975    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21820  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  69.22 
 
 		 690 aa  844    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1675  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 723 aa  1440    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0725077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  35.26 
 
 		 726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  32.36 
 
 		 1025 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  28.32 
 
 		 985 aa  146  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  28.46 
 
 		 848 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.99 
 
 		 1108 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  29.74 
 
 		 621 aa  145  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  26.27 
 
 		 1073 aa  144  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 		 1104 aa  143  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  28.75 
 
 		 1021 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  27.31 
 
 		 1082 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  27.97 
 
 		 906 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 1073 aa  142  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  27.31 
 
 		 1082 aa  142  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  26.06 
 
 		 1071 aa  142  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  26.82 
 
 		 1070 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 1073 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.22 
 
 		 1069 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  25.83 
 
 		 1068 aa  140  7e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.51 
 
 		 1073 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  27.1 
 
 		 1082 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 		 1073 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.2 
 
 		 988 aa  140  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  25.17 
 
 		 1068 aa  138  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  29.12 
 
 		 773 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  27.46 
 
 		 914 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.79 
 
 		 1091 aa  137  7.000000000000001e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.25 
 
 		 1155 aa  137  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 1112 aa  137  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.87 
 
 		 650 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.41 
 
 		 1091 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  28.19 
 
 		 959 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  30.29 
 
 		 1126 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  26.87 
 
 		 1134 aa  135  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  27.46 
 
 		 918 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 		 1403 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  28.84 
 
 		 903 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  27.77 
 
 		 1055 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 		 898 aa  134  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  27.78 
 
 		 1386 aa  134  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  28.95 
 
 		 1112 aa  134  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  28.01 
 
 		 1150 aa  134  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  28.78 
 
 		 663 aa  133  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 1261 aa  134  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  25.42 
 
 		 1181 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 		 1449 aa  133  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  27.35 
 
 		 1362 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  27.38 
 
 		 1072 aa  133  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  28.54 
 
 		 1086 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 		 1068 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  24.21 
 
 		 1152 aa  132  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  26.29 
 
 		 1003 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  26.02 
 
 		 1080 aa  132  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 		 1048 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  28.12 
 
 		 1354 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  27.37 
 
 		 1130 aa  131  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  27.71 
 
 		 917 aa  130  7.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  28.24 
 
 		 1105 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  25.61 
 
 		 1202 aa  130  8.000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  26.32 
 
 		 1031 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  28.57 
 
 		 674 aa  130  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  27.31 
 
 		 1088 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 1105 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24775  predicted protein  24.14 
 
 		 711 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  28.05 
 
 		 666 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.48 
 
 		 1129 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  27.27 
 
 		 1078 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  26.8 
 
 		 1070 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  28.75 
 
 		 1381 aa  128  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  28.3 
 
 		 901 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  25.33 
 
 		 1032 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  23.44 
 
 		 1093 aa  128  5e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  26.93 
 
 		 648 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 		 876 aa  127  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  25.27 
 
 		 956 aa  127  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  27.76 
 
 		 574 aa  127  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  27.02 
 
 		 1120 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  26.32 
 
 		 1437 aa  127  9e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  27.92 
 
 		 1141 aa  127  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.59 
 
 		 950 aa  126  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 		 1068 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.1 
 
 		 1102 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  27.42 
 
 		 1127 aa  126  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  23.33 
 
 		 1194 aa  126  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 		 922 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  28.32 
 
 		 1096 aa  126  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  26.95 
 
 		 1164 aa  126  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  28.08 
 
 		 1086 aa  125  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.16 
 
 		 1227 aa  125  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  25.71 
 
 		 1120 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  26.07 
 
 		 1062 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  27.56 
 
 		 777 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 		 617 aa  125  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 1113 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  27.33 
 
 		 1113 aa  124  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  27.07 
 
 		 1250 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>