More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1520 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  100 
 
 		 650 aa  1332    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  67.34 
 
 		 657 aa  884    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  67.34 
 
 		 658 aa  883    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  36.29 
 
 		 709 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  31.49 
 
 		 726 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  30.25 
 
 		 906 aa  158  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  31.85 
 
 		 1381 aa  146  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.65 
 
 		 559 aa  144  5e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  31.51 
 
 		 1284 aa  143  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  29.55 
 
 		 1437 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  31.08 
 
 		 1357 aa  138  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  30.05 
 
 		 1449 aa  137  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.65 
 
 		 988 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  28.43 
 
 		 617 aa  134  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  28.51 
 
 		 1386 aa  134  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  28.51 
 
 		 1362 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  27.2 
 
 		 574 aa  131  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.94 
 
 		 1112 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0896  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.49 
 
 		 917 aa  132  3e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00366837  hitchhiker  0.00000000137463 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  26.93 
 
 		 1134 aa  131  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  29.4 
 
 		 985 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  26.23 
 
 		 1130 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  29.96 
 
 		 1025 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  27.41 
 
 		 1069 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 		 1002 aa  131  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  28.06 
 
 		 918 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  27.88 
 
 		 918 aa  130  6e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 1047 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  28.94 
 
 		 1047 aa  130  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 918 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  27.91 
 
 		 918 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  27.91 
 
 		 918 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  27.91 
 
 		 918 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  27.53 
 
 		 1354 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  26.92 
 
 		 1019 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  27.74 
 
 		 1112 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  29.03 
 
 		 1164 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  27.73 
 
 		 918 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  27.73 
 
 		 918 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  27.78 
 
 		 918 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.7 
 
 		 1048 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  27.84 
 
 		 902 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  28.5 
 
 		 674 aa  128  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  26.88 
 
 		 1131 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  27.62 
 
 		 1064 aa  127  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  26.51 
 
 		 1069 aa  127  5e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2550  helicase domain protein  28.28 
 
 		 714 aa  127  8.000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310185  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 		 1021 aa  127  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.06 
 
 		 982 aa  127  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.05 
 
 		 1403 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  28.12 
 
 		 727 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  29.55 
 
 		 1080 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  27.55 
 
 		 1064 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  26.13 
 
 		 1087 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0038  DEAD/DEAH box helicase-like  30.66 
 
 		 534 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  27.6 
 
 		 918 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 		 1050 aa  125  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  29.25 
 
 		 746 aa  125  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  26.5 
 
 		 1181 aa  124  4e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 		 918 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 		 1152 aa  124  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  29.5 
 
 		 1019 aa  124  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  28.79 
 
 		 903 aa  124  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  27.49 
 
 		 1194 aa  123  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  26.47 
 
 		 1064 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  26.47 
 
 		 1064 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  26.47 
 
 		 1064 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  26.24 
 
 		 1064 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0034  DEAD/DEAH box helicase-like  29.44 
 
 		 531 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  26.47 
 
 		 1064 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4127  SNF2-related protein  28.51 
 
 		 885 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  27.39 
 
 		 1064 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  29.3 
 
 		 1055 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  30.75 
 
 		 638 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  26.47 
 
 		 1064 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 		 1074 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.94 
 
 		 1067 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2758  helicase domain protein  27.35 
 
 		 672 aa  122  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  25.99 
 
 		 1080 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  27.19 
 
 		 1250 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.81 
 
 		 1129 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 		 1068 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  28.57 
 
 		 1075 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  27.48 
 
 		 1202 aa  120  7e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  26.58 
 
 		 1003 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  26.62 
 
 		 959 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  27.63 
 
 		 892 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.86 
 
 		 1112 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  28.35 
 
 		 899 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 		 1164 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  26.07 
 
 		 1127 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  27.17 
 
 		 891 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 		 1066 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  28.13 
 
 		 621 aa  118  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  28.14 
 
 		 1259 aa  118  3.9999999999999997e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  27.94 
 
 		 1072 aa  117  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0825  SNF2-related protein  26.71 
 
 		 1122 aa  117  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  27.13 
 
 		 1120 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 1082 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10677  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  25.37 
 
 		 833 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.250944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>