More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2550 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2550  helicase domain protein  100 
 
 		 714 aa  1410    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21820  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  67.64 
 
 		 690 aa  832    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2758  helicase domain protein  66.57 
 
 		 672 aa  836    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0810  helicase domain protein  67.3 
 
 		 737 aa  867    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1675  helicase domain-containing protein  72.69 
 
 		 723 aa  974    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0725077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  35.14 
 
 		 726 aa  203  9e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  28.68 
 
 		 906 aa  153  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1108 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  31.26 
 
 		 1025 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  27.54 
 
 		 848 aa  146  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 		 1403 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  29.09 
 
 		 1112 aa  144  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  32.2 
 
 		 988 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  26.27 
 
 		 1194 aa  143  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 1112 aa  143  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  29.71 
 
 		 1021 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  28.48 
 
 		 1386 aa  142  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  28.46 
 
 		 650 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  25.78 
 
 		 1071 aa  142  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  25.37 
 
 		 1181 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  28.17 
 
 		 917 aa  141  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  28.05 
 
 		 1362 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  25.43 
 
 		 1068 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.66 
 
 		 1082 aa  140  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 		 1091 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  27.21 
 
 		 1070 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  28.51 
 
 		 621 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 		 1261 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  26.02 
 
 		 1134 aa  139  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  25.29 
 
 		 970 aa  138  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 1069 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  29.98 
 
 		 773 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  26.33 
 
 		 1111 aa  138  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 		 1102 aa  137  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  29.2 
 
 		 674 aa  137  7.000000000000001e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 		 1118 aa  136  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  26.39 
 
 		 1070 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 		 1055 aa  137  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  25.79 
 
 		 1068 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  28.6 
 
 		 1150 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.97 
 
 		 950 aa  135  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 		 1449 aa  136  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  26.82 
 
 		 1082 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  27.84 
 
 		 1250 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 1155 aa  135  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  28.42 
 
 		 1284 aa  135  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  27.69 
 
 		 1073 aa  134  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  26.82 
 
 		 1082 aa  134  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  25.81 
 
 		 1082 aa  134  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  29.61 
 
 		 663 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.46 
 
 		 1113 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  27.46 
 
 		 1113 aa  134  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  26.24 
 
 		 1023 aa  134  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.35 
 
 		 1091 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  29.37 
 
 		 985 aa  133  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  30.04 
 
 		 1126 aa  133  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 1105 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  25.86 
 
 		 1073 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  26.78 
 
 		 918 aa  132  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  26.79 
 
 		 1072 aa  132  3e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  28.26 
 
 		 657 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  25.6 
 
 		 1431 aa  131  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  27 
 
 		 1088 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  27.64 
 
 		 902 aa  130  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  25.27 
 
 		 1073 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  25.92 
 
 		 1437 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  28.26 
 
 		 658 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 		 1105 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  26.82 
 
 		 1064 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  27.74 
 
 		 1064 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 		 1068 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.84 
 
 		 1073 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  28.08 
 
 		 1381 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  28.21 
 
 		 1394 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.93 
 
 		 1068 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  26.36 
 
 		 1120 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02010  transcription activator snf2l1, putative  27.2 
 
 		 1096 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.606714  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  26.35 
 
 		 914 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  23.84 
 
 		 966 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 		 1066 aa  129  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  26.58 
 
 		 1120 aa  128  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  26.09 
 
 		 648 aa  128  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  27.08 
 
 		 666 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  26.65 
 
 		 1078 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  25.05 
 
 		 1073 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  26.52 
 
 		 1354 aa  128  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  26.94 
 
 		 1031 aa  128  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  26.46 
 
 		 1164 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  26.77 
 
 		 1062 aa  128  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  27.12 
 
 		 1064 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 		 898 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  26.94 
 
 		 1178 aa  127  5e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  24.37 
 
 		 1566 aa  127  6e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  27.61 
 
 		 1064 aa  127  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  26.83 
 
 		 1142 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.31 
 
 		 1048 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  26.92 
 
 		 1064 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  26.92 
 
 		 1064 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  26.92 
 
 		 1064 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  26.92 
 
 		 1064 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>