More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4468 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  67.34 
 
 		 650 aa  867    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  99.39 
 
 		 657 aa  1328    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  100 
 
 		 658 aa  1339    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  35.98 
 
 		 709 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  31.78 
 
 		 726 aa  166  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  31 
 
 		 906 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  31.78 
 
 		 1284 aa  148  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  30.16 
 
 		 1354 aa  143  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  31.19 
 
 		 1381 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  29.09 
 
 		 1120 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  32.13 
 
 		 985 aa  141  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  29.21 
 
 		 1120 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  27.68 
 
 		 1437 aa  140  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.69 
 
 		 1403 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  30.82 
 
 		 1449 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  29.53 
 
 		 1064 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 		 1002 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.72 
 
 		 1067 aa  139  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  29.3 
 
 		 1064 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  29.3 
 
 		 1064 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  29.3 
 
 		 1064 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  29.3 
 
 		 1064 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  29.3 
 
 		 1064 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  29.3 
 
 		 1064 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  29.23 
 
 		 574 aa  137  4e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 		 1047 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  29.26 
 
 		 1047 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  26.79 
 
 		 1134 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 617 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 		 1021 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  27.34 
 
 		 1250 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  28.4 
 
 		 1055 aa  134  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  29.53 
 
 		 1064 aa  134  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  28.83 
 
 		 902 aa  134  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 		 1112 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  29.84 
 
 		 1357 aa  133  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  29.36 
 
 		 1064 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  30.54 
 
 		 674 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  30.73 
 
 		 1086 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.31 
 
 		 988 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  27 
 
 		 959 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 1048 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  28.7 
 
 		 1072 aa  131  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 892 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  28.45 
 
 		 1063 aa  130  7.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  29.74 
 
 		 1019 aa  130  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  28.66 
 
 		 1075 aa  130  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  29.27 
 
 		 899 aa  130  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.08 
 
 		 559 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  27.11 
 
 		 1130 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  27.46 
 
 		 1127 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  29.49 
 
 		 1194 aa  129  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  27.39 
 
 		 1386 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6693  SNF2-related protein  29.3 
 
 		 1121 aa  128  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  27.11 
 
 		 1362 aa  128  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  26.4 
 
 		 1087 aa  128  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  27.12 
 
 		 1048 aa  128  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 1129 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.73 
 
 		 895 aa  127  5e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0282  SNF2 family helicase  28.31 
 
 		 1080 aa  127  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.157107  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.8 
 
 		 1099 aa  127  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 		 922 aa  127  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 		 918 aa  127  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  28.79 
 
 		 1185 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  28.39 
 
 		 1065 aa  127  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  28.76 
 
 		 621 aa  127  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  28.36 
 
 		 1019 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.97 
 
 		 1082 aa  126  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  26.44 
 
 		 891 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 		 1112 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  28.85 
 
 		 777 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  28.21 
 
 		 1066 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  28.41 
 
 		 1078 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  28 
 
 		 1112 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1068 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  28.51 
 
 		 1082 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4264  SNF2-related protein  28.14 
 
 		 1259 aa  125  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 		 1152 aa  125  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  27.51 
 
 		 1181 aa  125  4e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  28.81 
 
 		 1062 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  28.94 
 
 		 1025 aa  124  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 		 1073 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  26.85 
 
 		 1069 aa  124  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  28.92 
 
 		 1164 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  28.51 
 
 		 1070 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  26.95 
 
 		 918 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 1073 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  27.38 
 
 		 1082 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  27.16 
 
 		 918 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  26.95 
 
 		 918 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  26.95 
 
 		 918 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  26.95 
 
 		 918 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  26.95 
 
 		 918 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  26.6 
 
 		 918 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  27.38 
 
 		 1082 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.89 
 
 		 1082 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  27.16 
 
 		 918 aa  121  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  25.95 
 
 		 1069 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2939  SNF2-related protein  27.56 
 
 		 1131 aa  121  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  26.75 
 
 		 918 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>