More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2686 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  100 
 
 
709 aa  1439    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  36.74 
 
 
650 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  35.98 
 
 
658 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  35.67 
 
 
657 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  29.72 
 
 
906 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  29.21 
 
 
1130 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  27.78 
 
 
1127 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  29.21 
 
 
1284 aa  153  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  29.68 
 
 
1354 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  31.13 
 
 
726 aa  151  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 
1129 aa  150  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  29.3 
 
 
1134 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 
982 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  26.32 
 
 
1181 aa  144  4e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  28.36 
 
 
1048 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  27.9 
 
 
1152 aa  143  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  29.91 
 
 
1003 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  29.89 
 
 
1070 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  29.37 
 
 
1120 aa  142  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.79 
 
 
977 aa  142  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  29.52 
 
 
1386 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
1403 aa  140  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  29.52 
 
 
1362 aa  141  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  29.72 
 
 
1062 aa  140  6e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  30.2 
 
 
746 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  28.69 
 
 
918 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  28.69 
 
 
918 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  28.69 
 
 
918 aa  140  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 
1055 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  28.69 
 
 
918 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  28.69 
 
 
918 aa  139  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  28.98 
 
 
918 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  28.69 
 
 
918 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  28.98 
 
 
918 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  27.88 
 
 
1437 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  29.37 
 
 
1088 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 
1021 aa  138  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  28.69 
 
 
918 aa  138  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30360  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.52 
 
 
741 aa  137  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645533  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  28.6 
 
 
918 aa  137  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 
1112 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  28.73 
 
 
1120 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.68 
 
 
1068 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  29.19 
 
 
574 aa  135  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  31.18 
 
 
777 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  27.35 
 
 
959 aa  134  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  26.17 
 
 
1250 aa  134  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1608  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.02 
 
 
1112 aa  134  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  28.2 
 
 
964 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.54 
 
 
933 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.23 
 
 
1261 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  29.46 
 
 
1357 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4127  SNF2-related protein  28.42 
 
 
885 aa  132  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  28.93 
 
 
918 aa  132  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  27.31 
 
 
1084 aa  132  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  30.56 
 
 
903 aa  132  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 
1066 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  28.67 
 
 
1002 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  28.81 
 
 
1025 aa  130  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  27.23 
 
 
886 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  28.51 
 
 
1381 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  26.33 
 
 
1087 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 
1068 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  28.57 
 
 
924 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.23 
 
 
1031 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  24.38 
 
 
966 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  27.09 
 
 
1084 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.83 
 
 
559 aa  128  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  27 
 
 
1064 aa  129  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  26.78 
 
 
1064 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  26.85 
 
 
1068 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  29.56 
 
 
727 aa  128  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  29.09 
 
 
1082 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  27.1 
 
 
1064 aa  127  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  29.15 
 
 
985 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0896  SNF2 family DNA/RNA helicase  26.78 
 
 
917 aa  127  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00366837  hitchhiker  0.00000000137463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  26.88 
 
 
1064 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  26.88 
 
 
1064 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  26.88 
 
 
1064 aa  127  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  26.88 
 
 
1064 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 
895 aa  127  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 
1069 aa  127  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  26.88 
 
 
1064 aa  127  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
1164 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0825  SNF2-related protein  27.89 
 
 
1122 aa  127  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.33 
 
 
1082 aa  126  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  25.43 
 
 
1175 aa  126  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  29.42 
 
 
1070 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.44 
 
 
1028 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  27.67 
 
 
1194 aa  125  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 
1089 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
925 aa  126  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  28.6 
 
 
1080 aa  126  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  27.17 
 
 
1071 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.63 
 
 
1102 aa  125  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 
1048 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  28.45 
 
 
1082 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  28.69 
 
 
1019 aa  125  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  28.6 
 
 
1082 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  26.67 
 
 
1064 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>