More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4285 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  100 
 
 
906 aa  1861    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  28.31 
 
 
574 aa  197  5.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  31.83 
 
 
638 aa  197  9e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  30.5 
 
 
726 aa  178  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  30 
 
 
988 aa  171  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  30.64 
 
 
1381 aa  171  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  29.72 
 
 
709 aa  162  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  31 
 
 
658 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  31 
 
 
657 aa  160  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.45 
 
 
559 aa  160  8e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 
1449 aa  159  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  29.51 
 
 
1025 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.25 
 
 
650 aa  158  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.46 
 
 
1102 aa  152  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  29.77 
 
 
777 aa  151  4e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04187  TBP associated factor (Mot1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G05830)  26.7 
 
 
1904 aa  151  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  28.02 
 
 
495 aa  150  7e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12759  predicted protein  27.14 
 
 
956 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0485802  normal  0.764276 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  27.2 
 
 
1284 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30157  chromatin remodeling complex Adenosinetriphosphatase  26.35 
 
 
1222 aa  149  2.0000000000000003e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.986183 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4415  helicase domain protein  28.28 
 
 
762 aa  149  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.872942 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  28.95 
 
 
1065 aa  149  3e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  29.38 
 
 
1002 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  27.33 
 
 
1055 aa  148  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 
633 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  26.97 
 
 
918 aa  146  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1867  SNF2-related  27.34 
 
 
886 aa  146  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  26.48 
 
 
1362 aa  146  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  29.81 
 
 
991 aa  146  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  26.8 
 
 
1111 aa  145  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  26.4 
 
 
1084 aa  144  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  25.73 
 
 
1202 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  26.06 
 
 
1386 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.48 
 
 
1113 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  27.11 
 
 
1354 aa  143  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  26.2 
 
 
1084 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  26.42 
 
 
1021 aa  144  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  30.48 
 
 
1113 aa  143  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.87 
 
 
1099 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  26.77 
 
 
918 aa  143  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  26.77 
 
 
918 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  27.48 
 
 
1084 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  28.06 
 
 
1141 aa  142  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  26.84 
 
 
621 aa  142  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26262  predicted protein  28.19 
 
 
1148 aa  142  3e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0746999  normal  0.233167 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46007  predicted protein  28.06 
 
 
773 aa  142  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  28.13 
 
 
1063 aa  142  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  26.57 
 
 
918 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  26.57 
 
 
918 aa  141  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  28.57 
 
 
1437 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  27.18 
 
 
1078 aa  141  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  26.57 
 
 
918 aa  141  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  28.68 
 
 
918 aa  141  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  27.05 
 
 
1072 aa  140  8.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  28.4 
 
 
901 aa  140  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  28.19 
 
 
1394 aa  140  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  26.38 
 
 
918 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  30.13 
 
 
1091 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  26.77 
 
 
918 aa  139  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0034  DEAD/DEAH box helicase-like  29.15 
 
 
531 aa  139  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
1066 aa  139  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2550  helicase domain protein  28.82 
 
 
714 aa  139  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310185  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10043  ATPase (Eurofung)  25.39 
 
 
648 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.282737  normal  0.199288 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  27.26 
 
 
995 aa  139  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  26.77 
 
 
918 aa  139  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
922 aa  138  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  27.84 
 
 
1178 aa  138  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  28.34 
 
 
914 aa  137  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
918 aa  137  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  27.03 
 
 
1159 aa  137  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  27.29 
 
 
1068 aa  137  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  26.98 
 
 
1082 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00371  superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family protein  28.32 
 
 
542 aa  137  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0038  DEAD/DEAH box helicase-like  30.47 
 
 
534 aa  136  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.45 
 
 
1067 aa  135  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85702  Nuclear protein STH1/NPS1 (Chromatin structure remodeling complex protein STH1) (SNF2 homolog)  27.13 
 
 
1259 aa  135  5e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.250535  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  29.18 
 
 
663 aa  135  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  27.74 
 
 
1033 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.2 
 
 
1089 aa  135  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.86 
 
 
1104 aa  134  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  25.72 
 
 
1566 aa  134  6.999999999999999e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  26.37 
 
 
589 aa  134  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.44 
 
 
1155 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.92 
 
 
1028 aa  134  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 
918 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 
1048 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  26 
 
 
1407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  26.3 
 
 
1558 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  27.19 
 
 
1082 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  26.36 
 
 
1050 aa  132  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  27 
 
 
1082 aa  132  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  28.83 
 
 
1080 aa  132  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  26.99 
 
 
1068 aa  132  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  25.95 
 
 
1069 aa  132  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  25.95 
 
 
1357 aa  131  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 
1403 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  26.43 
 
 
985 aa  131  6e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  28.29 
 
 
1086 aa  131  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  28.49 
 
 
773 aa  131  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  24.81 
 
 
1175 aa  130  7.000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>