More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82083 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  100 
 
 		 1127 aa  2331    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  34.65 
 
 		 1202 aa  533  1e-149  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  32.05 
 
 		 1198 aa  433  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  29.13 
 
 		 900 aa  289  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  29.81 
 
 		 715 aa  271  4e-71  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  31.12 
 
 		 701 aa  267  1e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  30.19 
 
 		 1045 aa  265  3e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  29.1 
 
 		 972 aa  264  6.999999999999999e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  28.82 
 
 		 1170 aa  244  9e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  29.87 
 
 		 1086 aa  228  6e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  29.87 
 
 		 806 aa  227  8e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  28.05 
 
 		 707 aa  217  9.999999999999999e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  28.08 
 
 		 1359 aa  209  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  27.26 
 
 		 842 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  32.73 
 
 		 1184 aa  196  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1277 aa  192  2.9999999999999997e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  34.01 
 
 		 1132 aa  182  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  26.85 
 
 		 849 aa  164  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  26.91 
 
 		 832 aa  152  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  40.49 
 
 		 1142 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  35.79 
 
 		 1096 aa  127  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  44.31 
 
 		 1120 aa  127  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  44.31 
 
 		 1120 aa  127  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  41.67 
 
 		 1127 aa  126  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  38.51 
 
 		 985 aa  126  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  46.48 
 
 		 1134 aa  125  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  41.56 
 
 		 1164 aa  125  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  38.89 
 
 		 1159 aa  125  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  42.86 
 
 		 1130 aa  124  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  39.16 
 
 		 1250 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.21 
 
 		 1129 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 		 1164 aa  122  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  40.45 
 
 		 1087 aa  121  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 		 1068 aa  121  7.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  38.25 
 
 		 1064 aa  121  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  42.14 
 
 		 1077 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.68 
 
 		 1110 aa  121  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.2 
 
 		 1112 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  37.64 
 
 		 959 aa  121  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  36.47 
 
 		 1112 aa  120  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 982 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  37.7 
 
 		 1064 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  30.59 
 
 		 1362 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  37.7 
 
 		 1064 aa  119  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  30.26 
 
 		 1386 aa  119  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  40.35 
 
 		 939 aa  119  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  39.51 
 
 		 1125 aa  119  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  39.87 
 
 		 1062 aa  119  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  38.25 
 
 		 1068 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  40.13 
 
 		 1163 aa  119  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  40.12 
 
 		 1080 aa  119  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  37.7 
 
 		 1064 aa  118  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  37.7 
 
 		 1064 aa  118  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  37.7 
 
 		 1064 aa  118  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  41.88 
 
 		 1091 aa  118  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  37.7 
 
 		 1064 aa  118  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  38.99 
 
 		 977 aa  118  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  37.7 
 
 		 1064 aa  118  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  37.7 
 
 		 1064 aa  118  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1088 aa  117  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  42.42 
 
 		 1088 aa  118  7.999999999999999e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  40.51 
 
 		 1071 aa  118  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  37.64 
 
 		 1003 aa  117  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  41.26 
 
 		 964 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  38.2 
 
 		 1032 aa  117  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  38.15 
 
 		 1066 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  38.17 
 
 		 1068 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 1066 aa  116  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  38.61 
 
 		 1068 aa  116  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  41.61 
 
 		 1069 aa  116  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  41.61 
 
 		 1069 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.87 
 
 		 1068 aa  115  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.25 
 
 		 1082 aa  115  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.87 
 
 		 1069 aa  115  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  41.26 
 
 		 1055 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  39.51 
 
 		 1021 aa  115  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  39.51 
 
 		 1034 aa  114  8.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  40.33 
 
 		 1194 aa  114  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 		 1102 aa  114  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  38.27 
 
 		 1084 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  39.22 
 
 		 1084 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  37.95 
 
 		 1531 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.52 
 
 		 1171 aa  114  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.55 
 
 		 1261 aa  113  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  26.97 
 
 		 1086 aa  113  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  41.91 
 
 		 1178 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.15 
 
 		 950 aa  113  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3363  non-specific serine/threonine protein kinase  28.38 
 
 		 1050 aa  113  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  30.72 
 
 		 848 aa  114  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 1091 aa  112  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3603  non-specific serine/threonine protein kinase  29.04 
 
 		 1074 aa  112  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.760293  hitchhiker  0.0015393 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.27 
 
 		 1082 aa  112  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  37.65 
 
 		 291 aa  112  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  35.38 
 
 		 988 aa  112  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  38.73 
 
 		 1072 aa  112  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  39.02 
 
 		 1357 aa  112  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 		 1118 aa  112  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  35 
 
 		 1394 aa  112  6e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40 
 
 		 1102 aa  111  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  40.69 
 
 		 1078 aa  111  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>