More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNJ01630 on replicon NC_006679
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  100 
 
 		 1359 aa  2821    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  28.71 
 
 		 1170 aa  254  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  28.47 
 
 		 1202 aa  223  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  28.29 
 
 		 1127 aa  209  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  25.45 
 
 		 701 aa  208  7e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  25.56 
 
 		 900 aa  201  6e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  25.3 
 
 		 1045 aa  193  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04590  conserved hypothetical protein  23.71 
 
 		 1246 aa  145  7e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  24.49 
 
 		 1198 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1277 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  29.49 
 
 		 972 aa  138  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  47.73 
 
 		 1132 aa  135  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  42.25 
 
 		 1112 aa  134  9e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  45.03 
 
 		 849 aa  132  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  46.47 
 
 		 1134 aa  129  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  39.51 
 
 		 1068 aa  129  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  27.89 
 
 		 1184 aa  128  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  39.57 
 
 		 985 aa  128  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  49.22 
 
 		 1261 aa  127  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.88 
 
 		 982 aa  126  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  40.91 
 
 		 1055 aa  125  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  42.97 
 
 		 1250 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  42.68 
 
 		 1066 aa  124  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  38.89 
 
 		 1021 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  39.07 
 
 		 842 aa  124  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.59 
 
 		 1129 aa  123  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  40.72 
 
 		 1159 aa  123  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  42.86 
 
 		 1127 aa  122  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  43.97 
 
 		 1110 aa  121  7e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  39.74 
 
 		 715 aa  121  7.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  48 
 
 		 1081 aa  120  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  44.88 
 
 		 959 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  38.92 
 
 		 977 aa  120  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  44.59 
 
 		 1130 aa  119  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  43.14 
 
 		 1069 aa  119  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  41.29 
 
 		 1142 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  43.14 
 
 		 1069 aa  119  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  46.46 
 
 		 1284 aa  119  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  43.36 
 
 		 1120 aa  119  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.24 
 
 		 1160 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  43.36 
 
 		 1120 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.31 
 
 		 1102 aa  117  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  39.64 
 
 		 1154 aa  117  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62265  snf family helicase  23.29 
 
 		 1557 aa  116  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.510209 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  42.11 
 
 		 1113 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  46.31 
 
 		 1100 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.11 
 
 		 1113 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  42.33 
 
 		 1091 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  46.55 
 
 		 832 aa  117  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  42.42 
 
 		 872 aa  117  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  27.25 
 
 		 707 aa  116  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  40.91 
 
 		 964 aa  115  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  41.32 
 
 		 1108 aa  115  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  44.68 
 
 		 1143 aa  114  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  40.16 
 
 		 1003 aa  114  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  37.91 
 
 		 806 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  46.83 
 
 		 1125 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  44.44 
 
 		 1163 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  37.91 
 
 		 1086 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.67 
 
 		 1403 aa  113  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  40.41 
 
 		 1062 aa  113  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  33.62 
 
 		 1164 aa  113  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.94 
 
 		 1102 aa  112  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.53 
 
 		 1171 aa  112  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.73 
 
 		 1227 aa  112  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02285  Putative DNA helicase ino80 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BAZ5]  32.69 
 
 		 1612 aa  112  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.885389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  42.66 
 
 		 773 aa  111  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.85 
 
 		 1082 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  37.04 
 
 		 1071 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  43.36 
 
 		 663 aa  111  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  42.52 
 
 		 1357 aa  110  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 		 1155 aa  110  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  39.26 
 
 		 914 aa  110  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 		 1069 aa  110  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  43.31 
 
 		 1362 aa  110  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  40.72 
 
 		 1082 aa  110  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.46 
 
 		 1112 aa  109  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  39.26 
 
 		 918 aa  110  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  41.45 
 
 		 1105 aa  109  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 1068 aa  110  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  45.24 
 
 		 1084 aa  109  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  45.24 
 
 		 1084 aa  110  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  44.68 
 
 		 1070 aa  110  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.29 
 
 		 1118 aa  109  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  41.45 
 
 		 1105 aa  109  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 		 1091 aa  109  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 		 876 aa  108  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  42.52 
 
 		 1386 aa  108  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  39.26 
 
 		 1080 aa  108  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 		 1090 aa  108  7e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  41.45 
 
 		 666 aa  108  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.46 
 
 		 1089 aa  108  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  45.67 
 
 		 1141 aa  108  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  40.12 
 
 		 1082 aa  108  8e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  40.12 
 
 		 1082 aa  108  8e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  43.88 
 
 		 1150 aa  108  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  39.22 
 
 		 1449 aa  108  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  41.73 
 
 		 939 aa  107  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  42.52 
 
 		 896 aa  107  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_65204  DNA ATP-dependent helicase similar to Snf2p  35.17 
 
 		 1269 aa  107  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.066494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>