More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL05190 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  100 
 
 		 900 aa  1863    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  34.94 
 
 		 972 aa  445  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  30.45 
 
 		 1202 aa  294  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  29.39 
 
 		 1127 aa  288  2.9999999999999996e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  28.86 
 
 		 1198 aa  278  5e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  28.16 
 
 		 701 aa  247  6.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  28.16 
 
 		 715 aa  238  3e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  28.63 
 
 		 842 aa  227  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  27.83 
 
 		 1045 aa  222  3e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  25.14 
 
 		 1359 aa  199  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01040  hypothetical protein  28 
 
 		 1277 aa  162  3e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  28.22 
 
 		 1150 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  25.69 
 
 		 1086 aa  158  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  25.69 
 
 		 806 aa  157  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  27.79 
 
 		 707 aa  155  4e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  27.57 
 
 		 1132 aa  154  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  29.41 
 
 		 1184 aa  151  6e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  41.38 
 
 		 1159 aa  150  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  31.59 
 
 		 1170 aa  149  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  44.44 
 
 		 985 aa  147  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03090  helicase, putative  27.12 
 
 		 926 aa  145  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  40.95 
 
 		 1120 aa  140  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  41.43 
 
 		 1120 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.59 
 
 		 1102 aa  137  9e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88824  transcriptional accessory protein involved in TBP (TATA-binding protein) regulation helicase MOT1  26.41 
 
 		 1901 aa  135  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.44938  normal  0.674411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.38 
 
 		 1110 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  44.72 
 
 		 1142 aa  134  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01024  SNF2 family helicase/ATPase PasG, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13010)  26.45 
 
 		 868 aa  133  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  28.97 
 
 		 849 aa  132  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  40.56 
 
 		 1062 aa  132  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40 
 
 		 1143 aa  131  7.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  46.2 
 
 		 1084 aa  131  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  45.91 
 
 		 1084 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  38.81 
 
 		 1112 aa  129  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  41.71 
 
 		 1394 aa  128  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.99 
 
 		 1160 aa  128  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  41.99 
 
 		 1154 aa  128  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  25.26 
 
 		 939 aa  127  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  44.72 
 
 		 1357 aa  127  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  40.49 
 
 		 959 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  37.26 
 
 		 1250 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  39.57 
 
 		 964 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  44 
 
 		 1089 aa  124  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  47.41 
 
 		 1102 aa  124  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.81 
 
 		 1118 aa  123  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  32.2 
 
 		 617 aa  124  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  41.1 
 
 		 1025 aa  123  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.44 
 
 		 1031 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  40.23 
 
 		 1068 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.12 
 
 		 1047 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  41.1 
 
 		 988 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  42.45 
 
 		 1087 aa  122  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  41.14 
 
 		 991 aa  122  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 		 1120 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  39.91 
 
 		 1164 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  26.91 
 
 		 1047 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  39.08 
 
 		 1064 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  39.08 
 
 		 1064 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  39.08 
 
 		 1064 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  39.08 
 
 		 1064 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  39.08 
 
 		 1064 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  39.08 
 
 		 1064 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  45.38 
 
 		 977 aa  120  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  37.17 
 
 		 1227 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  39.08 
 
 		 1064 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  39.08 
 
 		 1064 aa  120  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  38.99 
 
 		 1066 aa  119  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  27.55 
 
 		 1072 aa  119  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  40.78 
 
 		 1163 aa  119  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  38.51 
 
 		 1064 aa  119  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  30.72 
 
 		 1040 aa  118  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  46.88 
 
 		 1164 aa  117  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  38.6 
 
 		 1386 aa  117  6.9999999999999995e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.78 
 
 		 982 aa  117  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.11 
 
 		 1113 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  46.92 
 
 		 1082 aa  117  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12310  predicted protein  42.75 
 
 		 140 aa  116  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.462485  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  30.2 
 
 		 1078 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  40.11 
 
 		 1113 aa  117  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  42.48 
 
 		 1081 aa  117  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  36.14 
 
 		 1096 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  37.02 
 
 		 1178 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  38.01 
 
 		 1362 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 		 848 aa  116  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  39.22 
 
 		 1003 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  44.03 
 
 		 1069 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  44.03 
 
 		 1069 aa  115  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  30.46 
 
 		 1082 aa  115  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  31.42 
 
 		 1073 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  36 
 
 		 1209 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  25.06 
 
 		 1175 aa  114  5e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  40.3 
 
 		 1125 aa  115  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  40.74 
 
 		 291 aa  114  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  44.79 
 
 		 1134 aa  114  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  39.87 
 
 		 1066 aa  114  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  43.57 
 
 		 1090 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  30.46 
 
 		 1082 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  40.59 
 
 		 1080 aa  114  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  31.99 
 
 		 1073 aa  114  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  30.92 
 
 		 1048 aa  114  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>