More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_04272 on replicon BN001302
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  100 
 
 
849 aa  1759    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  53.73 
 
 
701 aa  413  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  46.51 
 
 
1045 aa  349  1e-94  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  38.48 
 
 
707 aa  263  6.999999999999999e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  35.28 
 
 
1086 aa  243  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  35.28 
 
 
806 aa  241  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01240  conserved hypothetical protein  28.08 
 
 
842 aa  184  7e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  25.91 
 
 
972 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 
1104 aa  171  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  27.51 
 
 
1198 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  28.54 
 
 
1125 aa  164  6e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  26.84 
 
 
1127 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2387  non-specific serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 
1090 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  26.65 
 
 
1127 aa  159  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  27.73 
 
 
1055 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  44.25 
 
 
959 aa  145  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  27.98 
 
 
1161 aa  144  6e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2215  non-specific serine/threonine protein kinase  26.56 
 
 
1110 aa  144  9e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00386976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  26.39 
 
 
1088 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  38.86 
 
 
1184 aa  142  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  45.7 
 
 
1250 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2733  SNF2-related protein  41.62 
 
 
1164 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000591247  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
1068 aa  138  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  44.17 
 
 
1159 aa  138  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  41.48 
 
 
1112 aa  137  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  26.22 
 
 
1070 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  40.7 
 
 
1120 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  40.7 
 
 
1120 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3328  non-specific serine/threonine protein kinase  45.03 
 
 
1066 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  40.12 
 
 
1142 aa  135  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 
1021 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  43.35 
 
 
985 aa  134  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  42.48 
 
 
1069 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  42.48 
 
 
1069 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  43.68 
 
 
1086 aa  131  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  28.97 
 
 
900 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  45.03 
 
 
1359 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07103  DNA repair protein Rhp26/Rad26, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03840)  25.15 
 
 
1193 aa  131  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.183241  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.02 
 
 
1113 aa  131  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  43.02 
 
 
1113 aa  131  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  29.1 
 
 
1357 aa  130  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  40.7 
 
 
1164 aa  130  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  41.38 
 
 
1091 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.48 
 
 
982 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  42.76 
 
 
1437 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.83 
 
 
1129 aa  128  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  40.8 
 
 
1130 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  44.19 
 
 
1132 aa  127  9e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  38.73 
 
 
1362 aa  127  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  24.19 
 
 
1185 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  38.15 
 
 
1386 aa  126  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.63 
 
 
1102 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.72 
 
 
1261 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  31.47 
 
 
1202 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  42.53 
 
 
773 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  47.01 
 
 
1134 aa  125  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  37.36 
 
 
1096 aa  125  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  43.06 
 
 
1025 aa  125  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  45.52 
 
 
988 aa  124  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  25 
 
 
1194 aa  124  7e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  42.2 
 
 
663 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.12 
 
 
1155 aa  124  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38436  predicted protein  24.78 
 
 
609 aa  124  8e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  40.23 
 
 
1154 aa  124  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  40.7 
 
 
1150 aa  124  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59609  SNF2 family DNA-dependent ATPase  38.51 
 
 
715 aa  124  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561177  normal  0.329781 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  41.06 
 
 
977 aa  124  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.86 
 
 
1160 aa  123  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  41.72 
 
 
1062 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  42.86 
 
 
1381 aa  122  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  38.82 
 
 
1081 aa  122  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  34.05 
 
 
1403 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  42.31 
 
 
777 aa  121  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  41.04 
 
 
1110 aa  121  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  39.87 
 
 
1284 aa  120  7e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  40.94 
 
 
1100 aa  120  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.89 
 
 
1112 aa  120  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  41.81 
 
 
1086 aa  120  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  40.76 
 
 
1170 aa  119  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  39.08 
 
 
964 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  40 
 
 
1084 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  39.2 
 
 
1084 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  43.54 
 
 
1102 aa  119  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.7 
 
 
1171 aa  118  3.9999999999999997e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  42.38 
 
 
1071 aa  118  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  38.73 
 
 
1143 aa  118  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  40.67 
 
 
1077 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  43.05 
 
 
848 aa  117  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  40 
 
 
1003 aa  117  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.05 
 
 
1069 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  42 
 
 
1080 aa  117  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.72 
 
 
1091 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  42.76 
 
 
914 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  44.12 
 
 
1209 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  42.38 
 
 
1073 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.45 
 
 
1082 aa  115  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  42.76 
 
 
918 aa  115  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  40.79 
 
 
1163 aa  115  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.22 
 
 
1118 aa  115  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  40.74 
 
 
291 aa  115  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>