More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12310 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_12310  predicted protein  100 
 
 		 140 aa  286  6e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.462485  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00044  DNA repair protein rad5 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BHD6]  43.31 
 
 		 1202 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  46.32 
 
 		 1159 aa  118  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05190  SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 3, putative  42.75 
 
 		 900 aa  116  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  40.71 
 
 		 959 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1914  superfamily II DNA/RNA helicase  43.07 
 
 		 1394 aa  111  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  43.48 
 
 		 1250 aa  110  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  44.93 
 
 		 985 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82083  ATPase/DNA helicase  38.89 
 
 		 1127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0870755  normal  0.86553 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02850  DNA repair protein RAD5, putative  38.69 
 
 		 1198 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  40.44 
 
 		 1142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  42.75 
 
 		 1437 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.34 
 
 		 1089 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00510  DNA repair protein rad16, putative  41.61 
 
 		 1045 aa  104  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17517  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  42.03 
 
 		 1381 aa  103  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.34 
 
 		 1102 aa  103  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05483  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  40.71 
 
 		 1184 aa  102  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  39.86 
 
 		 1284 aa  102  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.58 
 
 		 1082 aa  103  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.73 
 
 		 1261 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.41 
 
 		 1118 aa  102  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  42.03 
 
 		 988 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  40.58 
 
 		 991 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  41.18 
 
 		 1120 aa  100  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36534  predicted protein  39.29 
 
 		 806 aa  100  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00151979  normal  0.0248069 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27249  predicted protein  39.29 
 
 		 1086 aa  100  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.355537 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  41.18 
 
 		 1120 aa  100  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  42.03 
 
 		 964 aa  99.4  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1035  helicase domain-containing protein  36.5 
 
 		 291 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  40.58 
 
 		 1362 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  42.75 
 
 		 982 aa  98.6  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  39.86 
 
 		 1084 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  39.86 
 
 		 1084 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  40.58 
 
 		 1386 aa  98.2  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  42.75 
 
 		 1062 aa  98.6  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  37.68 
 
 		 1087 aa  98.6  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_49179  nucleotide excision repair protein  37.23 
 
 		 701 aa  98.2  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.191959  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 		 1082 aa  97.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.01 
 
 		 1155 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  40.15 
 
 		 1102 aa  97.4  6e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.68 
 
 		 1112 aa  97.1  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  41.61 
 
 		 1163 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  39.13 
 
 		 1025 aa  97.1  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  36.23 
 
 		 1125 aa  97.1  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  37.68 
 
 		 1077 aa  97.1  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10794  single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  38.13 
 
 		 1170 aa  96.7  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690136  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01630  DNA repair protein RAD5, putative  33.58 
 
 		 1359 aa  96.3  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.911888  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  38.41 
 
 		 1357 aa  95.9  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  40.88 
 
 		 1160 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  41.61 
 
 		 1154 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 		 1449 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  40.58 
 
 		 1181 aa  95.5  2e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4402  non-specific serine/threonine protein kinase  39.26 
 
 		 1164 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.218588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.42 
 
 		 1110 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  40.58 
 
 		 1070 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  38.41 
 
 		 1403 aa  95.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  38.41 
 
 		 1130 aa  95.9  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 		 1055 aa  94.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  39.29 
 
 		 1068 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  40.58 
 
 		 1069 aa  94.4  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  40.58 
 
 		 1069 aa  94.7  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28568  predicted protein  37.67 
 
 		 707 aa  94.4  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.43424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 		 1104 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1664  putative helicase  40.15 
 
 		 1150 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0566301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  39.13 
 
 		 1088 aa  93.6  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  37.68 
 
 		 1354 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  38.41 
 
 		 1021 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 		 1073 aa  93.2  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  39.13 
 
 		 1080 aa  92.8  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 		 1073 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  36.23 
 
 		 1064 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 		 1073 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 1129 aa  92.4  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0770  SNF2-related protein  38.24 
 
 		 1081 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.57 
 
 		 1073 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04272  DNA excision repair protein Rad16, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G03820)  40.15 
 
 		 849 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00313474 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07538  ATP-dependent DNA helicase (Eurofung)  38.13 
 
 		 1132 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  36.23 
 
 		 1064 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  40.88 
 
 		 1086 aa  91.3  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  39.13 
 
 		 1073 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33727  conserved hypothetical protein  38.57 
 
 		 832 aa  91.3  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.191175 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  40.88 
 
 		 872 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  39.13 
 
 		 1112 aa  90.9  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  40.58 
 
 		 1068 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3350  SNF2-related protein  38.41 
 
 		 1127 aa  90.9  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.932326  normal  0.174859 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  35 
 
 		 1064 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  38.69 
 
 		 1134 aa  90.5  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  39.57 
 
 		 1091 aa  90.5  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  40.15 
 
 		 977 aa  90.5  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02256  SNF2 family helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06590)  36.23 
 
 		 972 aa  90.5  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.362577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  35.51 
 
 		 1068 aa  90.1  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  35.51 
 
 		 1064 aa  89.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  35.51 
 
 		 1064 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  39.42 
 
 		 1086 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  35.51 
 
 		 1064 aa  89.4  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  37.14 
 
 		 1096 aa  89.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  37.96 
 
 		 1171 aa  89.4  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1892  SNF2-related protein  40.15 
 
 		 1161 aa  89  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.500803 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  39.13 
 
 		 1070 aa  88.6  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  39.42 
 
 		 1143 aa  89.4  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>