More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_4415 on replicon NC_011879
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011879  Achl_4415  helicase domain protein  100 
 
 		 762 aa  1563    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.872942 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2724  helicase domain protein  36.09 
 
 		 648 aa  291  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000143899  hitchhiker  0.000226715 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  29.07 
 
 		 906 aa  157  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  29.61 
 
 		 574 aa  157  9e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  30.45 
 
 		 726 aa  141  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  27.24 
 
 		 638 aa  119  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.76 
 
 		 1139 aa  109  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2510  helicase domain protein  37.63 
 
 		 217 aa  107  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238792  hitchhiker  0.00294897 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  23.24 
 
 		 1084 aa  106  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  24.9 
 
 		 1065 aa  105  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  23.27 
 
 		 1069 aa  104  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  23.64 
 
 		 1069 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  23.03 
 
 		 1084 aa  103  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 		 1112 aa  99.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03230  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.01 
 
 		 1026 aa  98.6  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  24.17 
 
 		 1125 aa  98.2  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  24.31 
 
 		 1354 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  25.09 
 
 		 621 aa  95.5  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1653  SNF2-related protein  27.07 
 
 		 452 aa  94.7  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  24.39 
 
 		 1063 aa  94.7  6e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46007  predicted protein  27.32 
 
 		 773 aa  94.4  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2758  helicase domain protein  24.71 
 
 		 672 aa  94.4  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  25 
 
 		 1437 aa  92.8  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  24.27 
 
 		 977 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 		 1002 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  25.65 
 
 		 1091 aa  92  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  22.7 
 
 		 1134 aa  90.5  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  24.84 
 
 		 1163 aa  90.1  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  23.31 
 
 		 1284 aa  89.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2550  helicase domain protein  26.12 
 
 		 714 aa  89.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310185  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 617 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  25.18 
 
 		 1080 aa  89.4  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  23.23 
 
 		 1202 aa  88.6  4e-16  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.57 
 
 		 1143 aa  88.6  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.73 
 
 		 1403 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  22.01 
 
 		 1077 aa  87  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  24.14 
 
 		 1068 aa  87  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.76 
 
 		 1110 aa  87  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  25.05 
 
 		 1086 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  24.8 
 
 		 1141 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.56 
 
 		 1082 aa  86.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 		 1082 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  23.39 
 
 		 777 aa  85.9  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37662  predicted protein  24.61 
 
 		 589 aa  85.5  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0801404  normal  0.0201777 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.79 
 
 		 895 aa  85.1  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  25.46 
 
 		 658 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  23.26 
 
 		 1099 aa  84  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  25.46 
 
 		 657 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  23.33 
 
 		 1084 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.13 
 
 		 1160 aa  83.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  25.1 
 
 		 1023 aa  83.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  24.34 
 
 		 988 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  23.44 
 
 		 1067 aa  83.2  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  24.61 
 
 		 1047 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  22.26 
 
 		 891 aa  82.4  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  25.41 
 
 		 1025 aa  82.4  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  22.96 
 
 		 1055 aa  82  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  25.62 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  24.33 
 
 		 1362 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  24.55 
 
 		 1070 aa  81.6  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 		 1047 aa  81.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  23.32 
 
 		 1073 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  23.9 
 
 		 1227 aa  81.3  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57110  helicase of the Snf2/Rad54 family  22.02 
 
 		 1093 aa  81.3  0.00000000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.795427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  24.27 
 
 		 1154 aa  80.9  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.02 
 
 		 1073 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  23.72 
 
 		 1006 aa  80.9  0.00000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  23.14 
 
 		 1068 aa  80.9  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  24.17 
 
 		 1073 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  24.47 
 
 		 970 aa  80.5  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.04 
 
 		 1118 aa  79.7  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1651  Snf2 family protein  24.16 
 
 		 1070 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12135  helicase helZ  22.73 
 
 		 1013 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.013502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3472  SNF2-related protein  25.64 
 
 		 1100 aa  79.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  23.12 
 
 		 1007 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2469  SNF2-related protein  24.35 
 
 		 1120 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  24.21 
 
 		 1073 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  22.76 
 
 		 914 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  24.6 
 
 		 1082 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  25.89 
 
 		 985 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  22.62 
 
 		 918 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  25.29 
 
 		 1142 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  22.5 
 
 		 918 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.78 
 
 		 1007 aa  78.2  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6180  SNF2-related protein  22.67 
 
 		 1003 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  22.76 
 
 		 1104 aa  78.2  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  22.63 
 
 		 1048 aa  78.2  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  25.56 
 
 		 663 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  24.05 
 
 		 1120 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  23.92 
 
 		 1386 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  25.89 
 
 		 876 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  25.56 
 
 		 773 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  22.5 
 
 		 918 aa  77.4  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47011  predicted protein  24.03 
 
 		 1431 aa  76.6  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  27 
 
 		 650 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  24.04 
 
 		 1078 aa  77  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0810  helicase domain protein  25.73 
 
 		 737 aa  77  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  22.54 
 
 		 964 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  23.28 
 
 		 1072 aa  77.4  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  23.75 
 
 		 1073 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>