More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46007 on replicon NC_011676
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_46007  predicted protein  100 
 
 		 773 aa  1584    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0034  DEAD/DEAH box helicase-like  34.65 
 
 		 531 aa  251  3e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0038  DEAD/DEAH box helicase-like  34.07 
 
 		 534 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00371  superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family protein  34.65 
 
 		 542 aa  233  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  28.06 
 
 		 906 aa  141  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  29.05 
 
 		 1086 aa  135  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  28.21 
 
 		 777 aa  131  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  26.06 
 
 		 1284 aa  130  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  27.89 
 
 		 1134 aa  130  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  28.44 
 
 		 638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  28.6 
 
 		 1108 aa  128  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1088 aa  126  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1088 aa  125  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  25.47 
 
 		 918 aa  124  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  27.78 
 
 		 918 aa  124  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  27.57 
 
 		 914 aa  124  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  28.74 
 
 		 959 aa  124  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3931  SNF2-related  26.86 
 
 		 1178 aa  124  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  29.23 
 
 		 1088 aa  124  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  26.27 
 
 		 924 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  27.78 
 
 		 1025 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  25.05 
 
 		 918 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  25.05 
 
 		 918 aa  120  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  25.05 
 
 		 918 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  25.05 
 
 		 918 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  25.05 
 
 		 918 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  25.31 
 
 		 918 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  28.31 
 
 		 773 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  25.05 
 
 		 918 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  25.1 
 
 		 918 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  25.05 
 
 		 918 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  27.71 
 
 		 663 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  28.95 
 
 		 1080 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.18 
 
 		 925 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.85 
 
 		 1112 aa  119  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  28.64 
 
 		 1105 aa  118  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  28.31 
 
 		 896 aa  118  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 1357 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.85 
 
 		 933 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  26.15 
 
 		 1386 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  26.2 
 
 		 1362 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 		 1073 aa  114  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1673  SNF2-related  25.68 
 
 		 1048 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.115641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  28.7 
 
 		 666 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 		 1449 aa  113  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  26.32 
 
 		 1072 aa  113  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  28.16 
 
 		 1209 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1491  SNF2-related  29.62 
 
 		 1126 aa  112  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.318265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  24.35 
 
 		 1084 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 		 1105 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 		 1403 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  24.13 
 
 		 1084 aa  112  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  24.74 
 
 		 1065 aa  112  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  27.46 
 
 		 658 aa  111  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  26 
 
 		 1070 aa  111  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  23.88 
 
 		 918 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  27.93 
 
 		 657 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 		 1073 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  27.4 
 
 		 903 aa  110  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 		 1073 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3870  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  26.92 
 
 		 1091 aa  109  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  27.54 
 
 		 1437 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.55 
 
 		 1089 aa  109  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 		 1073 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.9 
 
 		 559 aa  108  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2839  SNF2-related  27.56 
 
 		 902 aa  108  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  26.62 
 
 		 977 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.59 
 
 		 1082 aa  108  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  23.58 
 
 		 574 aa  108  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  27.32 
 
 		 1130 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0265  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.83 
 
 		 1129 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355266  normal  0.1182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0516  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 		 1104 aa  107  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0578806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  28.94 
 
 		 709 aa  107  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  25.21 
 
 		 1163 aa  107  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  26.19 
 
 		 876 aa  107  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  26.48 
 
 		 1181 aa  107  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.08 
 
 		 1091 aa  106  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  28.19 
 
 		 1077 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  26.62 
 
 		 1354 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  25.48 
 
 		 1063 aa  105  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3874  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.43 
 
 		 1261 aa  105  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.646878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  25.62 
 
 		 901 aa  105  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.25 
 
 		 1171 aa  104  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3806  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.95 
 
 		 1048 aa  105  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  26.55 
 
 		 1078 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0104  SNF2-related protein  26.21 
 
 		 1086 aa  105  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02030  hypothetical protein  24.36 
 
 		 1558 aa  104  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0020  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.13 
 
 		 950 aa  104  7e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.64 
 
 		 907 aa  103  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  25.5 
 
 		 1154 aa  103  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  26.25 
 
 		 1111 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.41 
 
 		 1227 aa  103  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  25.05 
 
 		 1141 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  23.75 
 
 		 1069 aa  103  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.94 
 
 		 1160 aa  102  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.73 
 
 		 1110 aa  102  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  27.45 
 
 		 872 aa  102  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  26.75 
 
 		 1073 aa  102  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  26.97 
 
 		 988 aa  102  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  24.79 
 
 		 1067 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>