More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0038 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0034  DEAD/DEAH box helicase-like  80.87 
 
 
531 aa  860    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0038  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 
534 aa  1056    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00371  superfamily II DNA/RNA helicases, SNF2 family protein  67.11 
 
 
542 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_46007  predicted protein  34.36 
 
 
773 aa  248  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4285  helicase domain-containing protein  30.45 
 
 
906 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1520  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.14 
 
 
650 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.254537  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0726  SNF2-related protein  25.36 
 
 
574 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  29.15 
 
 
1065 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4468  SNF2 family helicase  31.47 
 
 
658 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59210  putative DNA helicase  32.85 
 
 
657 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00046214  hitchhiker  0.000203412 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  25.74 
 
 
1067 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  24.63 
 
 
918 aa  124  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  25.58 
 
 
918 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  28.8 
 
 
1386 aa  123  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  29.95 
 
 
1108 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  28.48 
 
 
674 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  28.65 
 
 
1086 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  26.8 
 
 
1284 aa  121  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  29.03 
 
 
1063 aa  121  3e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4822  helicase domain protein  32.27 
 
 
726 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.616254  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  28.12 
 
 
1362 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 
1449 aa  120  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  23.79 
 
 
918 aa  120  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  23.79 
 
 
918 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  23.79 
 
 
918 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  23.79 
 
 
918 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  23.79 
 
 
918 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  23.79 
 
 
918 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3596  non-specific serine/threonine protein kinase  29.43 
 
 
1105 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.270477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2146  Snf2/Rad54 family helicase  29.98 
 
 
666 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  23.79 
 
 
918 aa  118  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.04 
 
 
1403 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  24.21 
 
 
918 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  24.21 
 
 
918 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  24.73 
 
 
1084 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1687  non-specific serine/threonine protein kinase  29.98 
 
 
1105 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306833  normal  0.099326 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_18985  predicted protein  29.26 
 
 
638 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000565583  normal  0.824746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
617 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1894  SNF2-related:helicase, C-terminal:SWIM Zn-finger  27.83 
 
 
914 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.437669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30090  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  26.05 
 
 
1227 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  24.95 
 
 
1084 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2099  helicase/SNF2 family domain protein  27.38 
 
 
918 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  28.73 
 
 
621 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28381  SNF2 family DNA/RNA helicase  26.91 
 
 
1099 aa  109  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.590649 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.14 
 
 
1112 aa  108  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3314  SNF2-related protein  29.03 
 
 
1096 aa  108  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  26.92 
 
 
1159 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53900  helicase  30.23 
 
 
663 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.027485  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  27.47 
 
 
633 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
1082 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  28.95 
 
 
1357 aa  107  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3798  SNF2-related protein  25.49 
 
 
1154 aa  107  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0285  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.68 
 
 
1102 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2686  helicase domain-containing protein  27.78 
 
 
709 aa  107  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.683306  normal  0.559781 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.36 
 
 
1110 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  26.71 
 
 
1134 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4719  helicase  30.23 
 
 
773 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.218177  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  28.51 
 
 
1025 aa  103  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0053  SNF2-related protein  27.39 
 
 
1141 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0772  hypothetical protein  26.65 
 
 
1088 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  29.53 
 
 
777 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  23.19 
 
 
1139 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0956  SNF2-related  24.6 
 
 
1075 aa  102  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0419207  unclonable  0.0000716871 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  25.32 
 
 
1072 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0942  DNA helicase, SNF2/RAD54 family  28.84 
 
 
1113 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0801  hypothetical protein  26.44 
 
 
1088 aa  101  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1060  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 
1113 aa  101  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.28014  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2599  SNF2-related  27.48 
 
 
1437 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  28.02 
 
 
917 aa  102  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  23.6 
 
 
1069 aa  101  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  26.87 
 
 
1381 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 
933 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3868  SNF2-like  27.83 
 
 
896 aa  100  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  25.17 
 
 
1354 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  23.6 
 
 
1069 aa  100  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  24.73 
 
 
924 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  29.07 
 
 
872 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
895 aa  99.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3516  Non-specific serine/threonine protein kinase  25.74 
 
 
1160 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0485319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  24.19 
 
 
964 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.9 
 
 
988 aa  99  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  25.95 
 
 
1019 aa  99  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  26.17 
 
 
980 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1466  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 
1118 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266268  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  23.38 
 
 
891 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.22 
 
 
1082 aa  98.2  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2408  SNF2-related  28.76 
 
 
1163 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.644608  normal  0.0402994 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  26.79 
 
 
1070 aa  98.2  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  26.54 
 
 
1080 aa  98.2  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.35 
 
 
925 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  23.19 
 
 
1194 aa  97.8  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1748  SNF2-related protein  29.25 
 
 
1120 aa  97.8  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0290  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.09 
 
 
1047 aa  97.8  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0290  SNF2-related protein  26.52 
 
 
1047 aa  98.2  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  25.47 
 
 
1087 aa  97.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  30.15 
 
 
985 aa  97.1  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  24.78 
 
 
495 aa  96.7  9e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  29.4 
 
 
1142 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  27.93 
 
 
1073 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  28 
 
 
746 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>