More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4127 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0825  SNF2-related protein  53.61 
 
 		 1122 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4127  SNF2-related protein  100 
 
 		 885 aa  1731    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  49.85 
 
 		 746 aa  546  1e-154  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0415  SNF2-related protein  52.43 
 
 		 727 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30360  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  46.21 
 
 		 741 aa  461  9.999999999999999e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.645533  normal  0.197659 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0896  SNF2 family DNA/RNA helicase  36.61 
 
 		 917 aa  313  6.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00366837  hitchhiker  0.00000000137463 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1983  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 1089 aa  189  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  33.13 
 
 		 901 aa  181  5.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  32.31 
 
 		 1354 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.4 
 
 		 1034 aa  179  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  29.48 
 
 		 1250 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3047  putative helicase  30.27 
 
 		 1284 aa  177  9e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.149054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  28.54 
 
 		 959 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.65 
 
 		 1082 aa  173  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  30.45 
 
 		 1084 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1444  SNF2-related protein  27.76 
 
 		 891 aa  172  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0293  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.92 
 
 		 641 aa  171  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.95 
 
 		 1102 aa  171  6e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 1112 aa  171  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  29.08 
 
 		 1067 aa  169  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  29.76 
 
 		 1069 aa  166  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.31 
 
 		 1031 aa  165  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  31.61 
 
 		 1033 aa  165  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2473  SNF2-related protein  29.89 
 
 		 1362 aa  164  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.356302  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  30.72 
 
 		 1019 aa  164  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  29.91 
 
 		 980 aa  164  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.61 
 
 		 1139 aa  163  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  32.13 
 
 		 621 aa  163  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  28.81 
 
 		 1069 aa  164  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  27.11 
 
 		 1152 aa  164  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  29.27 
 
 		 1006 aa  162  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  30.11 
 
 		 1386 aa  162  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0433  SNF2-related protein  30.11 
 
 		 1130 aa  162  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.735104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4753  non-specific serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 		 633 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.830487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1793  SNF2-related protein  33.18 
 
 		 985 aa  162  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00186852  normal  0.607723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  28.13 
 
 		 924 aa  162  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  27.49 
 
 		 1194 aa  161  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1502  non-specific serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 		 1073 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3404  Snf2 family protein  28.73 
 
 		 1134 aa  161  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  30.87 
 
 		 1062 aa  161  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  30.67 
 
 		 1065 aa  160  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  29.21 
 
 		 1159 aa  160  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1300  SNF2-related protein  29.54 
 
 		 1070 aa  160  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  28.15 
 
 		 1071 aa  160  7e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2833  SNF2-related protein  32.87 
 
 		 991 aa  160  7e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 		 925 aa  160  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.54 
 
 		 1069 aa  160  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2541  non-specific serine/threonine protein kinase  32.05 
 
 		 922 aa  160  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0893525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 		 1082 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1013  Non-specific serine/threonine protein kinase  33.99 
 
 		 1029 aa  160  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.806419  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  27.44 
 
 		 1032 aa  159  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2228  SNF2-related  29.23 
 
 		 1088 aa  159  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  28.1 
 
 		 1084 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  28.1 
 
 		 1084 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  30.3 
 
 		 899 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1368  SNF2-related protein  29.67 
 
 		 1073 aa  158  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  27.07 
 
 		 1077 aa  157  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2580  non-specific serine/threonine protein kinase  26.77 
 
 		 1069 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00984411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  28.9 
 
 		 898 aa  157  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.98 
 
 		 1110 aa  157  8e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1466  non-specific serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 1073 aa  157  8e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  29.56 
 
 		 1040 aa  156  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  32.82 
 
 		 903 aa  157  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1331  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 		 933 aa  156  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  27.94 
 
 		 1068 aa  156  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1471  non-specific serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 		 1073 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.698518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2881  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.93 
 
 		 1073 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.596708  hitchhiker  0.0027523 
 
 
-
 
NC_002978  WD0610  SNF2 family helicase  28.76 
 
 		 1175 aa  155  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2620  SNF2-related protein  29.74 
 
 		 1082 aa  155  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228348 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2795  SNF2-related protein  29.74 
 
 		 1082 aa  155  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.320066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0114  SNF2-related protein  28.14 
 
 		 1080 aa  155  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  27.17 
 
 		 918 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  28.78 
 
 		 1007 aa  154  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  26.67 
 
 		 1087 aa  154  8.999999999999999e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  28.41 
 
 		 918 aa  154  8.999999999999999e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 1007 aa  153  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  27.17 
 
 		 918 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0547  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.04 
 
 		 988 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.122481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0994  SNF2-related:helicase-like:Zinc finger, SWIM-type  30.18 
 
 		 1142 aa  154  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.424079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5625  SNF2-related protein  28.48 
 
 		 1185 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  27.17 
 
 		 918 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5008  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.48 
 
 		 1403 aa  153  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  29.98 
 
 		 1063 aa  152  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  27.17 
 
 		 918 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6693  SNF2-related protein  32.47 
 
 		 1121 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  26.96 
 
 		 918 aa  152  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  32.23 
 
 		 1357 aa  152  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 617 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  26.52 
 
 		 918 aa  152  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2687  SNF2-related protein  29.52 
 
 		 1082 aa  152  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.846523  unclonable  0.000081012 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1371  helicase, SNF2/RAD54 family  29.26 
 
 		 1381 aa  152  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21150  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.71 
 
 		 1143 aa  151  4e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  26.96 
 
 		 918 aa  151  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  31.94 
 
 		 988 aa  151  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13550  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.27 
 
 		 907 aa  150  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  30.34 
 
 		 1112 aa  150  8e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  26.74 
 
 		 918 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  26.74 
 
 		 918 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  27.19 
 
 		 1068 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4161  SNF2-related protein  27.33 
 
 		 964 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000285202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>