16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1293 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1293  regulatory protein MerR  100 
 
 		 59 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  70.59 
 
 		 58 aa  86.3  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0923  hypothetical protein  47.46 
 
 		 62 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  54 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6363  hypothetical protein  58.82 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1445  excision promoter, Xis  47.06 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  50 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  59.57 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  45.45 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  42.59 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2294  hypothetical protein  46.94 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0824  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00274141  hitchhiker  0.0000530792 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3844  phage transcriptional regulator, AlpA  39.58 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.279149 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1174  phage transcriptional regulator, AlpA  38.33 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>