60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0794 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0794  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 80 aa  166  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1568  phage transcriptional regulator, AlpA  52.7 
 
 		 78 aa  88.2  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3400  excisionase/Xis, DNA-binding  50 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149044  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1445  excision promoter, Xis  44.23 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23900  MerR family regulatory protein  52.94 
 
 		 58 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0883926  normal  0.115779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0603  excisionase/Xis, DNA-binding protein  47.06 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.517756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3570  excisionase/Xis, DNA-binding  36.84 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201756 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2294  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3521  DNA binding domain protein, excisionase family  43.55 
 
 		 70 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0015  regulatory protein MerR  43.94 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2014  hypothetical protein  38.81 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6363  hypothetical protein  38 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5292  hypothetical protein  41.67 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1293  regulatory protein MerR  37.25 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2021  DNA binding domain protein, excisionase family  43.4 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1452  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2071  regulatory protein MerR  40.82 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000949054  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1800  hypothetical protein  39.39 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0545  DNA binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00223675  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0923  hypothetical protein  37.25 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4829  hypothetical protein  37.93 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0479763  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4915  hypothetical protein  37.93 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.315038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1723  hypothetical protein  31.67 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35990  hypothetical protein  38.46 
 
 		 89 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3473  DNA binding domain protein, excisionase family  33.82 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3583  hypothetical protein  42 
 
 		 95 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.529666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1923  hypothetical protein  41.27 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.422025  hitchhiker  0.00105597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2760  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466966 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0859  putative transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  36.21 
 
 		 251 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04063  VrlI like protein  42.55 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0561  DNA binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2648  Prophage CP4-57 regulatory  34.69 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1984  hypothetical protein  36.92 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216874  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16860  hypothetical protein  45.45 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.526145  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0685  hypothetical protein  36.92 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3732  hypothetical protein  36.92 
 
 		 94 aa  42  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2925  hypothetical protein  31.03 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.318513  normal  0.0737042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2607  hypothetical protein  36.92 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.879556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3559  hypothetical protein  41.07 
 
 		 89 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3025  hypothetical protein  32.43 
 
 		 108 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2722  hypothetical protein  32.43 
 
 		 98 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2338  hypothetical protein  41.07 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.440065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0824  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00274141  hitchhiker  0.0000530792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3527  hypothetical protein  33.87 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.585249  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7734  hypothetical protein  35.59 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2328  hypothetical protein  36.92 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1141  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1498  DNA binding domain protein, excisionase family  34 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1287  hypothetical protein  36.67 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1877  hypothetical protein  36.67 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3111  hypothetical protein  36.73 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2652  hypothetical protein  36.67 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.233996  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1253  hypothetical protein  36.67 
 
 		 105 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0810  DNA binding domain-containing protein  35.42 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0378139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1284  hypothetical protein  39.02 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0195028  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2195  phage transcriptional regulator, AlpA  39.13 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3682  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  36.17 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2934  hypothetical protein  33.87 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.903297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2530  phage transcriptional regulator, AlpA  37.1 
 
 		 71 aa  40  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>